37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1254 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  100 
 
 		 204 aa  408  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  65.62 
 
 		 203 aa  259  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  48.95 
 
 		 191 aa  175  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  49.19 
 
 		 191 aa  175  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  47.62 
 
 		 192 aa  168  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  46.49 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  48.65 
 
 		 192 aa  151  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 172 aa  125  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  40.11 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  37.64 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  38.04 
 
 		 176 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  30.81 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  34.86 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  35.43 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  33.71 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 175 aa  102  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  33.72 
 
 		 179 aa  99.4  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  35.98 
 
 		 181 aa  99.8  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  38.07 
 
 		 177 aa  98.6  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  36.11 
 
 		 184 aa  97.8  9e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  34.91 
 
 		 181 aa  95.1  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  35.23 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  37.5 
 
 		 184 aa  92  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  33.12 
 
 		 178 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  32.47 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  32.68 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  33.53 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  31.07 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  26.78 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  31.98 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  26.26 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  28.73 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2803  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.36 
 
 		 362 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0416971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  24.69 
 
 		 228 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2196  cytidylate kinase  41.46 
 
 		 233 aa  41.2  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>