58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0590 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  63.79 
 
 
176 aa  220  9e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  60.56 
 
 
182 aa  218  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  58.19 
 
 
177 aa  204  6e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  56.18 
 
 
178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  48.33 
 
 
180 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  46.24 
 
 
175 aa  153  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  43.79 
 
 
179 aa  144  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  43.35 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  41.52 
 
 
192 aa  133  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  42.77 
 
 
172 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  39.88 
 
 
191 aa  131  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  39.77 
 
 
191 aa  128  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  42.11 
 
 
192 aa  124  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  40.25 
 
 
184 aa  122  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  39.34 
 
 
180 aa  121  5e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  38.99 
 
 
178 aa  119  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  39.43 
 
 
184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  34.73 
 
 
189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  37.11 
 
 
184 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  36.47 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  39.24 
 
 
174 aa  111  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  39.62 
 
 
184 aa  111  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  38.51 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  37.27 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  39.43 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  37.34 
 
 
178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  38.75 
 
 
181 aa  105  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  35.98 
 
 
204 aa  99.8  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  32.48 
 
 
187 aa  91.7  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  30.77 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  26.44 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  27.54 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  28.4 
 
 
327 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  26.58 
 
 
327 aa  61.6  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  29.53 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  26.79 
 
 
225 aa  51.2  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1213  riboflavin biosynthesis protein RibF  25.28 
 
 
529 aa  45.1  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  26.21 
 
 
226 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  31.79 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  29.33 
 
 
220 aa  45.1  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1197  cytidylate kinase  27.21 
 
 
221 aa  44.7  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1440  cytidylate kinase  29.19 
 
 
224 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00955651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  25.81 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  28.67 
 
 
220 aa  43.9  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  30.07 
 
 
229 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  27.34 
 
 
212 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  29.25 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  26.53 
 
 
219 aa  42.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  28.68 
 
 
212 aa  42.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5059  cytidylate kinase  27.11 
 
 
225 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373389  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  24.83 
 
 
218 aa  42  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  32.67 
 
 
225 aa  42  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  37.8 
 
 
222 aa  41.6  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  37.8 
 
 
222 aa  41.6  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  25.5 
 
 
226 aa  41.6  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0508  cytidylate kinase  24.86 
 
 
221 aa  41.2  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0128  cytidylate kinase  25 
 
 
221 aa  40.8  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>