145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1364 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  76.63 
 
 		 184 aa  306  6.999999999999999e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  74.46 
 
 		 184 aa  296  1e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  75.54 
 
 		 184 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  49.44 
 
 		 181 aa  179  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  51.57 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  40.23 
 
 		 189 aa  153  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  44.3 
 
 		 180 aa  141  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  45.81 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  39.16 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  38.15 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  41.03 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  42.14 
 
 		 191 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  39.43 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  36.99 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  38.57 
 
 		 178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  39.1 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  37.86 
 
 		 178 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  37.82 
 
 		 175 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  40 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  37.5 
 
 		 178 aa  108  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  38.46 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  39.62 
 
 		 192 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  37.14 
 
 		 178 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  34.55 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  36.25 
 
 		 176 aa  100  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  33.95 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  33.14 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  37.5 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  27.27 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  32.5 
 
 		 203 aa  84.7  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  32.34 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  33.12 
 
 		 327 aa  75.1  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  32.5 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  31.88 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  27.33 
 
 		 213 aa  62  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  25.59 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  28.9 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0478  cytidylate kinase  25.12 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  28.5 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  26.88 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  27.56 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  28.31 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  26.42 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  24.88 
 
 		 514 aa  53.9  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  26.32 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2916  cytidylate kinase  26.28 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0479896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5059  cytidylate kinase  28.64 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373389  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 271 aa  51.6  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  22.36 
 
 		 251 aa  51.6  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0578  cytidylate kinase  22.33 
 
 		 222 aa  51.2  0.000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  29.61 
 
 		 243 aa  51.2  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  24.64 
 
 		 209 aa  51.2  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_002620  TC0737  cytidylate kinase  22.82 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  28.65 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2220  cytidylate kinase  27.78 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  25.99 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  29.41 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  26.54 
 
 		 227 aa  48.9  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  23.83 
 
 		 225 aa  48.5  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  27.62 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0128  cytidylate kinase  26.39 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  27.62 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  27.62 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1965  cytidylate kinase  25 
 
 		 232 aa  47.8  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1440  cytidylate kinase  26.74 
 
 		 224 aa  47.8  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00955651  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  23.53 
 
 		 511 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  23.53 
 
 		 511 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4881  hypothetical protein  27.44 
 
 		 216 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.997672  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  25.13 
 
 		 517 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  26.17 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  29.07 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1536  cytidylate kinase  25.57 
 
 		 237 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0931424  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  25.73 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  25.91 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  31.25 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  27.1 
 
 		 252 aa  45.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  24.06 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  27.22 
 
 		 219 aa  45.4  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  24.12 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  27.03 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  27.32 
 
 		 227 aa  45.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  27.22 
 
 		 219 aa  45.4  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  26.88 
 
 		 232 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  26.23 
 
 		 229 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf302  cytidylate kinase  23.44 
 
 		 223 aa  45.1  0.0006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.245847  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1497  Adenylate kinase  38.55 
 
 		 181 aa  45.1  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  25.24 
 
 		 212 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  26.09 
 
 		 214 aa  44.7  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  26.26 
 
 		 218 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  23.15 
 
 		 225 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1507  cytidylate kinase  22.77 
 
 		 209 aa  44.3  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000128864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  23.15 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  23.15 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  23.15 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0715  cytidylate kinase  30.2 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  25.58 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  25.58 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  24.59 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  23.15 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>