60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0107 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  100 
 
 
177 aa  356  8e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  58.19 
 
 
181 aa  204  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  59.09 
 
 
182 aa  203  8e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  57.47 
 
 
176 aa  199  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  52.25 
 
 
178 aa  182  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  54.49 
 
 
175 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  46.33 
 
 
180 aa  157  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  45.09 
 
 
172 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  42.6 
 
 
179 aa  136  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  46.2 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  42.77 
 
 
192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  45.09 
 
 
192 aa  131  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  41.95 
 
 
191 aa  131  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  45.57 
 
 
178 aa  131  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  39.88 
 
 
192 aa  128  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  44.94 
 
 
178 aa  127  6e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  41.38 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  37.93 
 
 
181 aa  118  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  43.23 
 
 
174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  36.21 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  38.15 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  33.33 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  40.62 
 
 
178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  38.41 
 
 
184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  42.77 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  39.63 
 
 
184 aa  111  5e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  34.83 
 
 
180 aa  111  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  40 
 
 
184 aa  102  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  38.07 
 
 
204 aa  98.6  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  32.94 
 
 
180 aa  89  3e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  32.39 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  26.09 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  30.06 
 
 
327 aa  74.3  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  30.54 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  28.74 
 
 
251 aa  62.4  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  24.83 
 
 
214 aa  53.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  26.8 
 
 
219 aa  50.8  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3248  hypothetical protein  29.57 
 
 
183 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  26.39 
 
 
212 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  25.18 
 
 
212 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  27.89 
 
 
213 aa  45.1  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1213  riboflavin biosynthesis protein RibF  24.58 
 
 
529 aa  44.7  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  24.77 
 
 
268 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  29.8 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0737  cytidylate kinase  24.5 
 
 
216 aa  43.9  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  25.83 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  41.18 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  26.03 
 
 
212 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5059  cytidylate kinase  24.3 
 
 
225 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373389  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0258  hypothetical protein  29.41 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.614825  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  25.57 
 
 
233 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  28.26 
 
 
215 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  25 
 
 
227 aa  42  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3593  hypothetical protein  27.73 
 
 
180 aa  41.6  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  24.34 
 
 
194 aa  41.6  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  21.58 
 
 
209 aa  41.2  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  41.67 
 
 
216 aa  41.2  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  41.67 
 
 
216 aa  41.2  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  32.84 
 
 
225 aa  41.2  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  45.95 
 
 
222 aa  40.8  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>