34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1866 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  660    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  89.54 
 
 		 327 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  34.68 
 
 		 192 aa  89.7  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  33.95 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  36.87 
 
 		 192 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  30 
 
 		 180 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  31.61 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  30.73 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  35.06 
 
 		 192 aa  82  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  35.22 
 
 		 172 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  33.52 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  30.06 
 
 		 177 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  32.5 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  30.34 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  31.87 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  31.25 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  27.75 
 
 		 182 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  29.75 
 
 		 178 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  27.11 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  26.01 
 
 		 189 aa  67  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  28.75 
 
 		 184 aa  65.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  28.4 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  33.7 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  26.88 
 
 		 184 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  25.48 
 
 		 174 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  28.73 
 
 		 204 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  25.77 
 
 		 178 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  27.53 
 
 		 203 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  24.84 
 
 		 178 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  24.54 
 
 		 178 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  25.99 
 
 		 187 aa  50.8  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  28.12 
 
 		 184 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  27.82 
 
 		 232 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5059  cytidylate kinase  51.11 
 
 		 225 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373389  normal  0.0397379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>