114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0626 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  100 
 
 
187 aa  371  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  51.57 
 
 
184 aa  158  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  43.58 
 
 
180 aa  158  5e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  46.33 
 
 
184 aa  156  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  43.58 
 
 
181 aa  156  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  52.5 
 
 
184 aa  153  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  46.54 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  40.8 
 
 
191 aa  134  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  41.38 
 
 
191 aa  134  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  36.26 
 
 
189 aa  134  9e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  41.95 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  39.66 
 
 
192 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  38.82 
 
 
172 aa  122  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  39.66 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  37.25 
 
 
178 aa  119  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  38.32 
 
 
179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  36.21 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  36.47 
 
 
181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  35.09 
 
 
182 aa  112  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  37.64 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  35.22 
 
 
178 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  36.52 
 
 
203 aa  104  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  33.99 
 
 
174 aa  103  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  34.12 
 
 
178 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  33.53 
 
 
176 aa  102  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  34.3 
 
 
175 aa  101  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  35.26 
 
 
180 aa  100  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  32.7 
 
 
178 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  34.59 
 
 
178 aa  100  9e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  33.33 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  27.91 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  29.48 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  34.43 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  33.7 
 
 
327 aa  61.6  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5660  hypothetical protein  25.73 
 
 
169 aa  51.2  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.444903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  35.96 
 
 
271 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  30 
 
 
215 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  30.95 
 
 
273 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  30.89 
 
 
273 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  22.36 
 
 
251 aa  49.7  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  31.41 
 
 
273 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  29.1 
 
 
275 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  35.96 
 
 
271 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  25.21 
 
 
232 aa  48.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  24.73 
 
 
226 aa  48.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1657  adenylate kinase, conjectural  41.25 
 
 
170 aa  47.8  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.160746  hitchhiker  0.0066831 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  22.6 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  41.46 
 
 
217 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1863  adenylate kinase  48.94 
 
 
389 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  24.74 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1213  riboflavin biosynthesis protein RibF  47.37 
 
 
529 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  41.46 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  32.67 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  50 
 
 
268 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  29.84 
 
 
275 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  45.71 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0760  cytidylate kinase  52.38 
 
 
230 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  24.04 
 
 
233 aa  45.1  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  32.35 
 
 
214 aa  45.1  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  25.47 
 
 
811 aa  45.1  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  26.04 
 
 
514 aa  44.7  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  26.38 
 
 
208 aa  44.7  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7072  predicted protein  30.63 
 
 
176 aa  44.7  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1965  cytidylate kinase  45.45 
 
 
232 aa  44.7  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459918  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  24.87 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  33.61 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  31.82 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  23.46 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  38.78 
 
 
234 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1452  cytidylate kinase  44.19 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.437148  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  48.57 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  32.81 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0594  adenylate kinase  40 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0420  adenylate kinase  47.06 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1313  adenylate kinase  25.4 
 
 
220 aa  43.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000294373  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1373  adenylate kinase  25.4 
 
 
220 aa  43.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000458386  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  25.82 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1398  adenylate kinase  40.54 
 
 
214 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  41.03 
 
 
231 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0490  adenylate kinase  31.13 
 
 
374 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2196  cytidylate kinase  32.31 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  38.89 
 
 
219 aa  42.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1536  cytidylate kinase  32.88 
 
 
237 aa  42.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0931424  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  42.11 
 
 
255 aa  42.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.5 
 
 
510 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  28.93 
 
 
214 aa  42.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  45.71 
 
 
228 aa  42.4  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1986  adenylate kinase, conjectural  50 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.975431  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5059  cytidylate kinase  46.15 
 
 
225 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373389  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  26.05 
 
 
483 aa  42  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  36.84 
 
 
225 aa  42  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  24.32 
 
 
227 aa  42  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf302  cytidylate kinase  34.43 
 
 
223 aa  42  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.245847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3061  cytidylate kinase  44.74 
 
 
242 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  26.07 
 
 
225 aa  41.6  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  45.24 
 
 
218 aa  41.6  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_6457  predicted protein  27.69 
 
 
196 aa  42  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  26.51 
 
 
228 aa  41.6  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  22.95 
 
 
232 aa  41.6  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  42 
 
 
217 aa  41.6  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>