17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5660 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5660  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  347  6e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.444903 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3893  hypothetical protein  25.15 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.188009 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1885  hypothetical protein  27.06 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00293921  normal  0.208652 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1509  hypothetical protein  24.73 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.154808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0843  hypothetical protein  23.48 
 
 		 173 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  25.73 
 
 		 187 aa  51.2  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1612  hypothetical protein  25.37 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1359  hypothetical protein  25.71 
 
 		 186 aa  44.3  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0452374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2220  ABC transporter related  30.17 
 
 		 492 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35 
 
 		 583 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  38.89 
 
 		 227 aa  42  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  34.43 
 
 		 219 aa  42  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  40 
 
 		 219 aa  41.6  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  32.39 
 
 		 222 aa  41.6  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  36.49 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  46.34 
 
 		 214 aa  41.2  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0737  cytidylate kinase  45.95 
 
 		 216 aa  40.8  0.009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>