More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2220 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1612  ABC transporter related  70.73 
 
 		 495 aa  723    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.052092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3229  ABC transporter related  70.1 
 
 		 495 aa  711    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736702  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2220  ABC transporter related  100 
 
 		 492 aa  1011    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2313  ABC transporter, ATP-binding protein  60.57 
 
 		 492 aa  630  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000196397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2271  ABC transporter, ATP-binding protein  60.16 
 
 		 492 aa  630  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2546  ABC transporter, ATP-binding protein  60.16 
 
 		 492 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.55199e-45 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1690  ABC transporter, ATP-binding protein  59.96 
 
 		 492 aa  626  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.359726  hitchhiker  0.0000000000000525976 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2355  ABC transporter ATP-binding protein  59.76 
 
 		 492 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0376605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2531  ABC transporter ATP-binding protein  59.76 
 
 		 492 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3162  ABC transporter related protein  61.59 
 
 		 488 aa  608  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0458111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3631  ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 460 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0497  ABC transporter, ATP-binding protein  52.44 
 
 		 523 aa  538  1e-151  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.208057 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2109  ABC transporter related  50.41 
 
 		 492 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0044  ABC transporter, ATP-binding protein  51.02 
 
 		 490 aa  509  1e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0818  ABC transporter ATPase  41.4 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000307399  normal  0.444871 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0976  ABC transporter ATPase  41.83 
 
 		 516 aa  376  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2020  ABC transporter related  35.03 
 
 		 522 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1961  ABC transporter related  27.7 
 
 		 577 aa  187  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  27.29 
 
 		 620 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  28.1 
 
 		 606 aa  182  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  29.77 
 
 		 542 aa  181  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1548  ABC transporter related  37.01 
 
 		 305 aa  180  4e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.98 
 
 		 548 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2620  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.98 
 
 		 542 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00269042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  29.56 
 
 		 548 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  27.76 
 
 		 643 aa  178  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2270  ABC transporter related protein  29.08 
 
 		 540 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.196548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  29.35 
 
 		 548 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  27.29 
 
 		 577 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  29.38 
 
 		 542 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  29.71 
 
 		 543 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  26.63 
 
 		 641 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1085  ABC transporter related  29.7 
 
 		 534 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000470508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  28.93 
 
 		 542 aa  172  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  28.81 
 
 		 636 aa  169  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  26.68 
 
 		 528 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  25.27 
 
 		 642 aa  168  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  25.27 
 
 		 642 aa  168  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  26.62 
 
 		 635 aa  168  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  28.84 
 
 		 544 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  27.45 
 
 		 580 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0904  ABC transporter related  25.89 
 
 		 527 aa  168  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467195  decreased coverage  0.00659199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4972  ABC transporter related  28.1 
 
 		 544 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  28.52 
 
 		 630 aa  166  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  25.64 
 
 		 644 aa  166  9e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  28.27 
 
 		 639 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  27.37 
 
 		 630 aa  166  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  25.94 
 
 		 636 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  27.17 
 
 		 610 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1435  ABC transporter-related protein  27.41 
 
 		 522 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5296  putative macrolide efflux pump  28.1 
 
 		 544 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  26.67 
 
 		 528 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0506  ABC transporter related  25.14 
 
 		 691 aa  164  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  26.94 
 
 		 620 aa  163  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  30.1 
 
 		 641 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  25.41 
 
 		 634 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.59 
 
 		 559 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  27.27 
 
 		 619 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  26.38 
 
 		 621 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  25.65 
 
 		 528 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0873  ABC transporter, ATP-binding protein  27.44 
 
 		 487 aa  161  3e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  27.47 
 
 		 641 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.79 
 
 		 559 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  26.19 
 
 		 621 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  26.51 
 
 		 659 aa  159  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  25.68 
 
 		 645 aa  159  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  26.73 
 
 		 529 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4057  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.86 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  25.55 
 
 		 528 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  26.08 
 
 		 621 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2791  ABC transporter related  27.66 
 
 		 487 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.741515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2428  ABC transporter related  25.48 
 
 		 625 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  26.58 
 
 		 632 aa  158  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.01 
 
 		 559 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0349  ABC transporter related  24.7 
 
 		 602 aa  158  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287299 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  25.6 
 
 		 709 aa  157  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  26.95 
 
 		 656 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4858  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  27.61 
 
 		 544 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2271  ABC transporter related  26.4 
 
 		 532 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.582561 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  24.45 
 
 		 634 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2153  ABC transporter, ATPase subunit  24.66 
 
 		 602 aa  157  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  24.72 
 
 		 528 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  26.42 
 
 		 690 aa  157  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.23 
 
 		 559 aa  156  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4024  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.68 
 
 		 554 aa  156  8e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.640286  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.68 
 
 		 554 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  25.14 
 
 		 528 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4873  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  27.25 
 
 		 544 aa  156  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  25.14 
 
 		 528 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  29.32 
 
 		 644 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  26.87 
 
 		 649 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0245  ABC transporter, ATP-binding protein  27.96 
 
 		 626 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  25.74 
 
 		 581 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  27.04 
 
 		 642 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  26.87 
 
 		 649 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6763  ABC transporter related  26.18 
 
 		 623 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0911  ABC transporter ATP-binding protein  26.04 
 
 		 523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  26.62 
 
 		 535 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.27 
 
 		 555 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2810  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.27 
 
 		 555 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>