More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1961 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1961  ABC transporter related  100 
 
 		 577 aa  1184    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  37.32 
 
 		 640 aa  297  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  35.82 
 
 		 630 aa  296  6e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  32.21 
 
 		 666 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2270  ABC transporter related protein  33.79 
 
 		 540 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.196548  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  36.08 
 
 		 569 aa  280  3e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  34.75 
 
 		 620 aa  276  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  33.63 
 
 		 634 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2620  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.2 
 
 		 542 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00269042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  34.29 
 
 		 581 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  31.59 
 
 		 641 aa  273  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  33.75 
 
 		 641 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  31.84 
 
 		 639 aa  272  1e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  33.13 
 
 		 542 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  32.98 
 
 		 644 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  34.29 
 
 		 536 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  32.99 
 
 		 548 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  32.58 
 
 		 542 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  32.73 
 
 		 636 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  32.58 
 
 		 548 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  32.14 
 
 		 643 aa  268  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  33.57 
 
 		 541 aa  266  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  32.79 
 
 		 548 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4972  ABC transporter related  31.39 
 
 		 544 aa  266  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  33.2 
 
 		 542 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  32.52 
 
 		 543 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  32.37 
 
 		 645 aa  263  4.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  31.49 
 
 		 649 aa  263  6e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.98 
 
 		 645 aa  263  6.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  32.5 
 
 		 627 aa  262  1e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  32.79 
 
 		 564 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  33.21 
 
 		 541 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  33.09 
 
 		 619 aa  262  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  31.36 
 
 		 635 aa  262  1e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4858  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  31.97 
 
 		 544 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  31.28 
 
 		 641 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  31.12 
 
 		 639 aa  261  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  32.92 
 
 		 564 aa  261  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  33.27 
 
 		 567 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  30.98 
 
 		 659 aa  260  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  32.31 
 
 		 575 aa  259  7e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  32.17 
 
 		 638 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  32.29 
 
 		 536 aa  258  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  32.42 
 
 		 636 aa  257  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2293  ABC transporter related  34.94 
 
 		 613 aa  258  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  32.62 
 
 		 638 aa  257  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  31.79 
 
 		 667 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  30.78 
 
 		 634 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  30.8 
 
 		 690 aa  255  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  30.54 
 
 		 545 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  30.73 
 
 		 629 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  31.53 
 
 		 653 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  33.45 
 
 		 574 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4873  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  31.19 
 
 		 544 aa  253  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5296  putative macrolide efflux pump  30.24 
 
 		 544 aa  252  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  35.09 
 
 		 632 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  30.92 
 
 		 636 aa  251  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  33.58 
 
 		 667 aa  252  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  31.65 
 
 		 646 aa  251  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  32.73 
 
 		 656 aa  251  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  29.54 
 
 		 560 aa  251  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  32.31 
 
 		 643 aa  251  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  32.49 
 
 		 643 aa  251  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5028  macrolide efflux pump  31.19 
 
 		 544 aa  251  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  31.36 
 
 		 630 aa  250  4e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5409  macrolide efflux pump  31.19 
 
 		 544 aa  251  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.952575  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  31.48 
 
 		 546 aa  250  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  29.39 
 
 		 688 aa  250  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  33.33 
 
 		 574 aa  250  6e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  31.75 
 
 		 659 aa  249  8e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13460  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.03 
 
 		 532 aa  248  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.576158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  31.93 
 
 		 659 aa  248  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  29.51 
 
 		 668 aa  248  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5266  putative macrolide efflux pump  31.02 
 
 		 544 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  29.53 
 
 		 632 aa  248  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  30.04 
 
 		 540 aa  246  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  31.81 
 
 		 535 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  30.83 
 
 		 659 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  30.76 
 
 		 540 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49454  ABC(ATP-binding) family transporter  30.07 
 
 		 649 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00209815  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  29.73 
 
 		 541 aa  243  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  29.58 
 
 		 630 aa  243  5e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  32.77 
 
 		 606 aa  243  6e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  31.39 
 
 		 638 aa  243  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  29.55 
 
 		 540 aa  243  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  31.71 
 
 		 644 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  31.43 
 
 		 540 aa  243  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  31.61 
 
 		 575 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  30.99 
 
 		 658 aa  243  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  32.73 
 
 		 654 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  30.22 
 
 		 540 aa  242  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  29.87 
 
 		 528 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  29.68 
 
 		 539 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  30.58 
 
 		 643 aa  242  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  31.53 
 
 		 644 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  30.37 
 
 		 632 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1935  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.17 
 
 		 550 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.461584  normal  0.714392 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31.53 
 
 		 662 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  28.6 
 
 		 540 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  30.51 
 
 		 540 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>