More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0976 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0976  ABC transporter ATPase  100 
 
 		 516 aa  1050    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0818  ABC transporter ATPase  40.98 
 
 		 501 aa  398  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000307399  normal  0.444871 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0044  ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 490 aa  378  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3162  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 488 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0458111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2220  ABC transporter related  41.83 
 
 		 492 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2313  ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 		 492 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000196397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2271  ABC transporter, ATP-binding protein  40.23 
 
 		 492 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3229  ABC transporter related  41.24 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736702  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1612  ABC transporter related  40.75 
 
 		 495 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.052092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2546  ABC transporter, ATP-binding protein  39.85 
 
 		 492 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.55199e-45 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1690  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 492 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.359726  hitchhiker  0.0000000000000525976 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2355  ABC transporter ATP-binding protein  39.47 
 
 		 492 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0376605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2531  ABC transporter ATP-binding protein  39.47 
 
 		 492 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2109  ABC transporter related  41.92 
 
 		 492 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0497  ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 		 523 aa  341  2e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.208057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3631  ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 		 460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2020  ABC transporter related  32.38 
 
 		 522 aa  282  9e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1548  ABC transporter related  41.12 
 
 		 305 aa  213  7e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  29.75 
 
 		 542 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  29.58 
 
 		 542 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  29.96 
 
 		 548 aa  183  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2620  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.39 
 
 		 542 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00269042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  29.56 
 
 		 548 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.39 
 
 		 634 aa  179  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  28.73 
 
 		 646 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  29.69 
 
 		 543 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  29.5 
 
 		 636 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.01 
 
 		 548 aa  178  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  29.77 
 
 		 542 aa  177  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  27.29 
 
 		 535 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  27.88 
 
 		 638 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  27.37 
 
 		 641 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 629 aa  171  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  28.06 
 
 		 622 aa  171  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  26.55 
 
 		 624 aa  170  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  27.54 
 
 		 656 aa  170  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  26.27 
 
 		 528 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  28.09 
 
 		 577 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1961  ABC transporter related  27.7 
 
 		 577 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  26.65 
 
 		 528 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  26.54 
 
 		 672 aa  168  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  26.57 
 
 		 606 aa  168  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  26.38 
 
 		 528 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.44 
 
 		 550 aa  167  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  28.83 
 
 		 627 aa  167  4e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  27.8 
 
 		 620 aa  167  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  27.66 
 
 		 634 aa  167  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  26.08 
 
 		 528 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2916  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.79 
 
 		 563 aa  167  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0621526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  26.08 
 
 		 528 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  26.53 
 
 		 663 aa  166  8e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0880  ABC transporter related  27.08 
 
 		 673 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  27.19 
 
 		 638 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  28.44 
 
 		 630 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.32 
 
 		 556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0876  ABC transporter-related protein  27.58 
 
 		 673 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  25.65 
 
 		 528 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.88 
 
 		 551 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  28.26 
 
 		 639 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2293  ABC transporter related  28.92 
 
 		 613 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  26.5 
 
 		 663 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11685  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  25.57 
 
 		 591 aa  163  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.819157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6573  ABC transporter related  25.05 
 
 		 623 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3463  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.15 
 
 		 550 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427951  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.08 
 
 		 670 aa  163  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.1 
 
 		 555 aa  162  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  26.64 
 
 		 659 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  26.65 
 
 		 541 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.31 
 
 		 635 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0830  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  27.15 
 
 		 673 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2722  ABC transporter related protein  23.9 
 
 		 631 aa  162  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.67 
 
 		 635 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.31 
 
 		 635 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.04 
 
 		 635 aa  161  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  26.53 
 
 		 685 aa  161  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2140  ABC transporter related  26.59 
 
 		 603 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.31 
 
 		 635 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.31 
 
 		 635 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  25.89 
 
 		 636 aa  161  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  27.14 
 
 		 632 aa  160  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  26.17 
 
 		 632 aa  160  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.31 
 
 		 635 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  26.97 
 
 		 641 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  26.49 
 
 		 637 aa  159  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  26.49 
 
 		 637 aa  159  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  26.49 
 
 		 637 aa  159  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.49 
 
 		 637 aa  159  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.49 
 
 		 637 aa  159  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  25.05 
 
 		 532 aa  159  8e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.49 
 
 		 637 aa  159  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.49 
 
 		 637 aa  159  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  27.32 
 
 		 645 aa  159  9e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0205  ABC transporter related  28.02 
 
 		 628 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  24.81 
 
 		 532 aa  159  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.49 
 
 		 637 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.85 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.99 
 
 		 637 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4972  ABC transporter related  25.61 
 
 		 544 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.69 
 
 		 637 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  28.68 
 
 		 564 aa  159  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>