More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3162 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3162  ABC transporter related protein  100 
 
 
488 aa  984    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0458111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2220  ABC transporter related  61.59 
 
 
492 aa  629  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2313  ABC transporter, ATP-binding protein  59.55 
 
 
492 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000196397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1612  ABC transporter related  60.57 
 
 
495 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.052092  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2546  ABC transporter, ATP-binding protein  59.15 
 
 
492 aa  611  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.55199e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2355  ABC transporter ATP-binding protein  58.74 
 
 
492 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0376605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2271  ABC transporter, ATP-binding protein  58.94 
 
 
492 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2531  ABC transporter ATP-binding protein  58.74 
 
 
492 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1690  ABC transporter, ATP-binding protein  58.94 
 
 
492 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.359726  hitchhiker  0.0000000000000525976 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3229  ABC transporter related  59.6 
 
 
495 aa  598  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3631  ABC transporter, ATP-binding protein  57.98 
 
 
460 aa  532  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0044  ABC transporter, ATP-binding protein  53.29 
 
 
490 aa  530  1e-149  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2109  ABC transporter related  50.82 
 
 
492 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0497  ABC transporter, ATP-binding protein  54.69 
 
 
523 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.208057 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0818  ABC transporter ATPase  40.16 
 
 
501 aa  394  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000307399  normal  0.444871 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0976  ABC transporter ATPase  42.91 
 
 
516 aa  385  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2020  ABC transporter related  35.67 
 
 
522 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  31.47 
 
 
542 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  31.97 
 
 
543 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  27.27 
 
 
620 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  31.39 
 
 
548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  31.55 
 
 
542 aa  183  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1548  ABC transporter related  40.07 
 
 
305 aa  183  7e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  31.5 
 
 
548 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2620  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.19 
 
 
542 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00269042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  32.19 
 
 
548 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  31.03 
 
 
542 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1961  ABC transporter related  26.21 
 
 
577 aa  179  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.97 
 
 
670 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.83 
 
 
559 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.32 
 
 
559 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.19 
 
 
559 aa  170  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  27.02 
 
 
634 aa  170  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.62 
 
 
559 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  26.7 
 
 
581 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  28.54 
 
 
606 aa  168  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21470  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  27.5 
 
 
529 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  27.59 
 
 
621 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  26.58 
 
 
709 aa  167  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.46 
 
 
555 aa  167  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  31.77 
 
 
636 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1670  ABC transporter related  26.55 
 
 
537 aa  166  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  26.19 
 
 
635 aa  166  8e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.32 
 
 
555 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4972  ABC transporter related  27 
 
 
544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0243  ABC transporter, ATP-binding protein  28.97 
 
 
626 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.592514  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  26.9 
 
 
620 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.05 
 
 
550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.08 
 
 
643 aa  165  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  27.27 
 
 
530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  27.7 
 
 
541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0204  ABC transporter, ATP-binding protein  29.04 
 
 
626 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  26.25 
 
 
529 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  29.27 
 
 
630 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  25 
 
 
688 aa  163  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2114  ABC transporter related  27.38 
 
 
532 aa  163  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.52 
 
 
561 aa  163  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1085  ABC transporter related  27.84 
 
 
534 aa  162  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000470508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.39 
 
 
555 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  25.05 
 
 
545 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0217  ABC transporter ATP-binding protein  28.62 
 
 
626 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5296  putative macrolide efflux pump  26.6 
 
 
544 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0228  ABC transporter ATP-binding protein  28.62 
 
 
626 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  26.42 
 
 
544 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.79 
 
 
555 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  25.74 
 
 
564 aa  161  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  27.01 
 
 
621 aa  161  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  26.86 
 
 
532 aa  161  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  24.09 
 
 
529 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.33 
 
 
561 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  26.82 
 
 
690 aa  161  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.94 
 
 
555 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.23 
 
 
555 aa  160  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2810  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.94 
 
 
555 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.29 
 
 
551 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  27.62 
 
 
580 aa  160  5e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  26.81 
 
 
621 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  26 
 
 
558 aa  160  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2722  ABC transporter related protein  26.14 
 
 
631 aa  159  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0571  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.98 
 
 
554 aa  160  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  27.29 
 
 
552 aa  159  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.33 
 
 
561 aa  159  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0245  ABC transporter, ATP-binding protein  28.62 
 
 
626 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2059  ABC transporter related protein  26.81 
 
 
542 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.455455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0238  ABC transporter, ATP-binding protein  28.26 
 
 
626 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.42 
 
 
555 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1411  ABC transporter related protein  28.6 
 
 
532 aa  159  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1858  ABC transporter related  27.38 
 
 
532 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00066186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.31 
 
 
553 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.57 
 
 
561 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  26.82 
 
 
536 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2147  ABC transporter related protein  26.17 
 
 
558 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03121  ABC transporter ATP-binding protein  25.23 
 
 
530 aa  158  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  26.35 
 
 
555 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.05 
 
 
558 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3514  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.05 
 
 
554 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491494  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2881  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.32 
 
 
555 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.41932  normal  0.0832413 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4057  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.24 
 
 
554 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.98 
 
 
555 aa  158  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.64 
 
 
556 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>