More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21470 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21470  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  100 
 
 		 529 aa  1074    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  80.23 
 
 		 530 aa  882    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  36.17 
 
 		 634 aa  353  5e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  36.42 
 
 		 767 aa  320  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  37.09 
 
 		 549 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.13 
 
 		 559 aa  309  9e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  31.3 
 
 		 639 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  37.72 
 
 		 545 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  35.71 
 
 		 540 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  33.27 
 
 		 634 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  35.06 
 
 		 638 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.93 
 
 		 561 aa  306  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  35.01 
 
 		 540 aa  306  7e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  34.82 
 
 		 540 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  35.71 
 
 		 540 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  34.82 
 
 		 540 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 		 559 aa  304  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  34.93 
 
 		 581 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2495  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.46 
 
 		 558 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.6 
 
 		 558 aa  303  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  34.87 
 
 		 540 aa  302  8.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.93 
 
 		 561 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  34.94 
 
 		 545 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  36.26 
 
 		 543 aa  301  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.93 
 
 		 559 aa  300  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  34.76 
 
 		 690 aa  300  3e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  34.93 
 
 		 672 aa  300  4e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.2 
 
 		 670 aa  300  4e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.93 
 
 		 561 aa  300  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.13 
 
 		 559 aa  300  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 		 561 aa  300  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  36.43 
 
 		 630 aa  300  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.24 
 
 		 558 aa  300  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  37.31 
 
 		 645 aa  299  9e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  34.93 
 
 		 540 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  35.95 
 
 		 544 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.47 
 
 		 558 aa  298  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  32.93 
 
 		 535 aa  298  2e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  36.19 
 
 		 540 aa  297  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  35.4 
 
 		 540 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  35.61 
 
 		 649 aa  297  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  36 
 
 		 540 aa  297  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0181  ferric-enterobactin ABC transporter ATPase  36.02 
 
 		 626 aa  296  5e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 		 560 aa  296  6e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  35.47 
 
 		 540 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0372  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.86 
 
 		 556 aa  296  6e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  34.67 
 
 		 649 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  35.76 
 
 		 542 aa  296  6e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  34.67 
 
 		 649 aa  296  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  33.86 
 
 		 555 aa  296  9e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.4 
 
 		 709 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.1 
 
 		 548 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  34.5 
 
 		 540 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  35.27 
 
 		 540 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  32.88 
 
 		 540 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.01 
 
 		 560 aa  295  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.77 
 
 		 559 aa  294  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.32 
 
 		 555 aa  293  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.86 
 
 		 559 aa  293  7e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  34.85 
 
 		 548 aa  292  8e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.66 
 
 		 559 aa  292  9e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.67 
 
 		 557 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  34.48 
 
 		 648 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.26 
 
 		 555 aa  292  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  34.85 
 
 		 548 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  33.14 
 
 		 540 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  35.07 
 
 		 539 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  34.6 
 
 		 636 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2845  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.47 
 
 		 559 aa  291  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 		 556 aa  291  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2713  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.25 
 
 		 555 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  34.35 
 
 		 575 aa  291  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  33.93 
 
 		 559 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.47 
 
 		 557 aa  290  6e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  33.14 
 
 		 638 aa  290  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.62 
 
 		 560 aa  290  6e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32.69 
 
 		 668 aa  289  7e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  34.91 
 
 		 645 aa  289  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0489  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.86 
 
 		 555 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.05 
 
 		 555 aa  289  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.86 
 
 		 555 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.86 
 
 		 705 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  33.21 
 
 		 633 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  32.88 
 
 		 632 aa  289  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 		 555 aa  289  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  31.23 
 
 		 666 aa  288  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  33.59 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  33.4 
 
 		 545 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  34.7 
 
 		 643 aa  288  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 641 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.66 
 
 		 555 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.21 
 
 		 559 aa  287  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  33.73 
 
 		 555 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0447  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.05 
 
 		 570 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46914  normal  0.303037 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2881  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.86 
 
 		 555 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.41932  normal  0.0832413 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.67 
 
 		 557 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  33.59 
 
 		 636 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  31.35 
 
 		 643 aa  287  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  34 
 
 		 555 aa  287  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.63 
 
 		 561 aa  286  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>