More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2109 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2109  ABC transporter related  100 
 
 		 492 aa  1005    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1612  ABC transporter related  52.24 
 
 		 495 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.052092  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2313  ABC transporter, ATP-binding protein  51.02 
 
 		 492 aa  534  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000196397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2271  ABC transporter, ATP-binding protein  51.02 
 
 		 492 aa  533  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11466  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2220  ABC transporter related  50.41 
 
 		 492 aa  529  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1690  ABC transporter, ATP-binding protein  50.61 
 
 		 492 aa  525  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.359726  hitchhiker  0.0000000000000525976 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2546  ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 		 492 aa  525  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.55199e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2355  ABC transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 		 492 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0376605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2531  ABC transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 		 492 aa  520  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3229  ABC transporter related  50.1 
 
 		 495 aa  521  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736702  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3162  ABC transporter related protein  50.82 
 
 		 488 aa  513  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0458111  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0044  ABC transporter, ATP-binding protein  47.76 
 
 		 490 aa  480  1e-134  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0497  ABC transporter, ATP-binding protein  46.34 
 
 		 523 aa  461  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.208057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3631  ABC transporter, ATP-binding protein  49.66 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0818  ABC transporter ATPase  40.24 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000307399  normal  0.444871 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0976  ABC transporter ATPase  41.92 
 
 		 516 aa  374  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2020  ABC transporter related  35.55 
 
 		 522 aa  324  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  29.18 
 
 		 542 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2620  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.24 
 
 		 542 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00269042  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  31.84 
 
 		 530 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.24 
 
 		 548 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  28.96 
 
 		 548 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  28.14 
 
 		 641 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  29.11 
 
 		 543 aa  186  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  28.36 
 
 		 548 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  28.6 
 
 		 542 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  29.03 
 
 		 542 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1961  ABC transporter related  28.69 
 
 		 577 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2270  ABC transporter related protein  28.15 
 
 		 540 aa  183  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.196548  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  28.65 
 
 		 606 aa  180  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1548  ABC transporter related  36.18 
 
 		 305 aa  179  9e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  28.32 
 
 		 528 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  27.82 
 
 		 620 aa  176  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  29.41 
 
 		 541 aa  176  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  29.73 
 
 		 534 aa  176  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  27.86 
 
 		 636 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  28.63 
 
 		 634 aa  174  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  30.34 
 
 		 531 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  26.92 
 
 		 659 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  25.68 
 
 		 644 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.96 
 
 		 637 aa  170  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0904  ABC transporter related  27.57 
 
 		 527 aa  169  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467195  decreased coverage  0.00659199 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  27.05 
 
 		 635 aa  169  7e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.4 
 
 		 640 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  27.71 
 
 		 577 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.4 
 
 		 640 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.21 
 
 		 640 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.41 
 
 		 637 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  28.41 
 
 		 637 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  28.41 
 
 		 637 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  26.15 
 
 		 529 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.41 
 
 		 637 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2140  ABC transporter related  29.2 
 
 		 603 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  30.3 
 
 		 525 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.41 
 
 		 637 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.41 
 
 		 637 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  28.41 
 
 		 637 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.41 
 
 		 637 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.41 
 
 		 637 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  26.13 
 
 		 639 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0972  ABC transporter related  28.52 
 
 		 626 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2717  putative UUP ATPase  28.8 
 
 		 607 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1375  ABC transporter related  28.8 
 
 		 607 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0588139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1919  ABC transporter related  28.74 
 
 		 603 aa  165  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.338599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  30.25 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.53 
 
 		 635 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  27.72 
 
 		 620 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  25.38 
 
 		 529 aa  164  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  27.13 
 
 		 621 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1714  ABC-transporter ATP-binding protein  28.48 
 
 		 614 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0650863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  32 
 
 		 541 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  26.93 
 
 		 621 aa  163  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.19 
 
 		 635 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4972  ABC transporter related  25.88 
 
 		 544 aa  163  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.19 
 
 		 635 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.19 
 
 		 635 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  26.43 
 
 		 649 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.78 
 
 		 635 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.88 
 
 		 555 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.88 
 
 		 555 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.88 
 
 		 555 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.88 
 
 		 555 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.52 
 
 		 550 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  27.22 
 
 		 529 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  25.94 
 
 		 627 aa  162  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.78 
 
 		 635 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1374  ABC transporter-related protein  27.63 
 
 		 610 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.88 
 
 		 555 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  26.19 
 
 		 658 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.88 
 
 		 555 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.34 
 
 		 635 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  24.38 
 
 		 634 aa  162  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.37 
 
 		 555 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.14 
 
 		 637 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  25.05 
 
 		 634 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3652  ABC transporter related  28.63 
 
 		 604 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.88 
 
 		 555 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  26.32 
 
 		 658 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  29.6 
 
 		 535 aa  161  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  26.32 
 
 		 658 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>