More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2020 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2020  ABC transporter related  100 
 
 		 522 aa  1070    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2313  ABC transporter, ATP-binding protein  36.79 
 
 		 492 aa  332  8e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000196397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2220  ABC transporter related  35.03 
 
 		 492 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2546  ABC transporter, ATP-binding protein  36.23 
 
 		 492 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.55199e-45 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3229  ABC transporter related  34.59 
 
 		 495 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2355  ABC transporter ATP-binding protein  35.85 
 
 		 492 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0376605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2531  ABC transporter ATP-binding protein  35.85 
 
 		 492 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1690  ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 		 492 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.359726  hitchhiker  0.0000000000000525976 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1612  ABC transporter related  35.45 
 
 		 495 aa  322  8e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.052092  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2271  ABC transporter, ATP-binding protein  35.85 
 
 		 492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11466  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3162  ABC transporter related protein  35.67 
 
 		 488 aa  316  7e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0458111  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2109  ABC transporter related  35.55 
 
 		 492 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0044  ABC transporter, ATP-binding protein  34.61 
 
 		 490 aa  303  6.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0976  ABC transporter ATPase  32.38 
 
 		 516 aa  282  9e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0497  ABC transporter, ATP-binding protein  32.83 
 
 		 523 aa  280  4e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.208057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3631  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 460 aa  276  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0818  ABC transporter ATPase  29.89 
 
 		 501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000307399  normal  0.444871 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.36 
 
 		 644 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  29.83 
 
 		 641 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  29.35 
 
 		 659 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  29 
 
 		 636 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  28.73 
 
 		 658 aa  206  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  28.73 
 
 		 640 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  28.73 
 
 		 658 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  29.52 
 
 		 635 aa  206  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  28.73 
 
 		 658 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  28.73 
 
 		 658 aa  205  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  28.73 
 
 		 658 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  28.54 
 
 		 644 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  28.54 
 
 		 662 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  29.41 
 
 		 634 aa  202  8e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  27.98 
 
 		 659 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  28.68 
 
 		 639 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  27.98 
 
 		 644 aa  200  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  30.28 
 
 		 636 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  29.78 
 
 		 642 aa  197  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  29.78 
 
 		 642 aa  197  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.55 
 
 		 644 aa  195  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  27.11 
 
 		 639 aa  194  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  28.31 
 
 		 606 aa  193  7e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  29.59 
 
 		 581 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  29.83 
 
 		 564 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  29.72 
 
 		 638 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  28.41 
 
 		 620 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.9 
 
 		 643 aa  187  4e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  28.49 
 
 		 636 aa  186  9e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0571  ABC transporter, ATP-binding protein  27.31 
 
 		 645 aa  186  9e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.940937  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  27.22 
 
 		 690 aa  185  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3883  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.89 
 
 		 559 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  26.95 
 
 		 645 aa  183  6e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  27.59 
 
 		 636 aa  183  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  26.65 
 
 		 533 aa  182  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0889  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.66 
 
 		 554 aa  182  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  29.11 
 
 		 577 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  26.12 
 
 		 666 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  27.61 
 
 		 540 aa  181  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  26.9 
 
 		 624 aa  180  4.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1183  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.64 
 
 		 554 aa  179  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.976373 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  27.48 
 
 		 672 aa  179  8e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0037  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.39 
 
 		 555 aa  179  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264543  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  27.81 
 
 		 663 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0036  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.39 
 
 		 555 aa  179  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0540  ABC transporter ATP-binding protein uup  29.09 
 
 		 644 aa  179  9e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.692263  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  26.52 
 
 		 643 aa  179  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2781  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.34 
 
 		 555 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.957442  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  28.38 
 
 		 575 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0524  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.76 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  27.1 
 
 		 540 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  26.92 
 
 		 540 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004402  ABC transporter ATP-binding protein  27.64 
 
 		 555 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.485845  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0929  ABC transporter related  26.82 
 
 		 714 aa  178  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.526225  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  26.92 
 
 		 540 aa  178  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.03 
 
 		 553 aa  178  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  27.86 
 
 		 540 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  27.81 
 
 		 548 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  28.7 
 
 		 646 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  28.3 
 
 		 667 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0967  ABC transporter, ATP-binding protein  26.7 
 
 		 643 aa  177  4e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1013  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.58 
 
 		 555 aa  177  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1270  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.06 
 
 		 555 aa  177  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0563  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.43 
 
 		 572 aa  177  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499297  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  27.6 
 
 		 536 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  26.81 
 
 		 532 aa  177  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  28.14 
 
 		 634 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  28.16 
 
 		 630 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1093  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.77 
 
 		 555 aa  177  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.53945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1159  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.77 
 
 		 555 aa  177  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.63 
 
 		 554 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  25.14 
 
 		 637 aa  176  8e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  26.62 
 
 		 643 aa  176  8e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3472  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.77 
 
 		 555 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.17 
 
 		 555 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5235  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.63 
 
 		 579 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  27.93 
 
 		 537 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  26.25 
 
 		 642 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  27.36 
 
 		 540 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1032  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.45 
 
 		 555 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  26.97 
 
 		 657 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3306  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.72 
 
 		 555 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1093  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.58 
 
 		 555 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>