More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0935 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  100 
 
 		 530 aa  1053    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  64.19 
 
 		 531 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  87.15 
 
 		 531 aa  926    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  62.36 
 
 		 534 aa  626  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  61.22 
 
 		 532 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  60.76 
 
 		 535 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  59.32 
 
 		 527 aa  607  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  60.95 
 
 		 524 aa  607  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  58.78 
 
 		 525 aa  582  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  54.67 
 
 		 533 aa  567  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  57.41 
 
 		 527 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  56.76 
 
 		 534 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  52.77 
 
 		 545 aa  509  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  49.81 
 
 		 526 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 524 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  39.96 
 
 		 534 aa  388  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  41.21 
 
 		 541 aa  359  7e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  42.23 
 
 		 554 aa  347  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.38 
 
 		 536 aa  343  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  39.85 
 
 		 535 aa  335  9e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  40.38 
 
 		 536 aa  333  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  42.67 
 
 		 549 aa  334  3e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  40.15 
 
 		 541 aa  332  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  39.81 
 
 		 544 aa  329  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  40.94 
 
 		 537 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  40.94 
 
 		 537 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  40.94 
 
 		 537 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  41.7 
 
 		 557 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  41.01 
 
 		 558 aa  317  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  41.09 
 
 		 553 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  39.92 
 
 		 553 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  37.4 
 
 		 539 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  39.73 
 
 		 555 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  39.66 
 
 		 565 aa  296  9e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.58 
 
 		 538 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  32.02 
 
 		 529 aa  291  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  32.51 
 
 		 529 aa  287  4e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  38.03 
 
 		 516 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.7 
 
 		 548 aa  280  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  31.95 
 
 		 528 aa  276  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  32.63 
 
 		 529 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  32.45 
 
 		 529 aa  272  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  33.15 
 
 		 530 aa  272  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  35.09 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.09 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.09 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  35.09 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  35.09 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.09 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.09 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  35.03 
 
 		 530 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  35.28 
 
 		 531 aa  269  8.999999999999999e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  35.09 
 
 		 535 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  36.73 
 
 		 546 aa  264  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  33.64 
 
 		 548 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.63 
 
 		 531 aa  262  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  35.86 
 
 		 546 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  33.52 
 
 		 523 aa  260  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  32.65 
 
 		 541 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  34.31 
 
 		 551 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  34.31 
 
 		 551 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  37.02 
 
 		 532 aa  259  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  34.98 
 
 		 550 aa  257  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  35.05 
 
 		 511 aa  256  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  34.25 
 
 		 548 aa  256  9e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  37.02 
 
 		 520 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  36.82 
 
 		 530 aa  251  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  35.73 
 
 		 535 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  33.27 
 
 		 525 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  33.59 
 
 		 525 aa  233  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0084  ABC transporter related  61.31 
 
 		 209 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  33.58 
 
 		 627 aa  217  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.01 
 
 		 634 aa  216  7e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  31.87 
 
 		 627 aa  215  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  31 
 
 		 627 aa  213  7.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  31 
 
 		 640 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  33.21 
 
 		 627 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  34.97 
 
 		 627 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.23 
 
 		 641 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  29.59 
 
 		 580 aa  211  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  31.39 
 
 		 636 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06389  hypothetical protein  31.81 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  31.16 
 
 		 643 aa  210  4e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  27.64 
 
 		 639 aa  209  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  32.53 
 
 		 644 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.44 
 
 		 555 aa  209  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1055  ABC transporter related  34.23 
 
 		 542 aa  206  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.59 
 
 		 639 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  32.02 
 
 		 620 aa  204  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  32.3 
 
 		 639 aa  203  5e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  32.96 
 
 		 642 aa  204  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2140  ABC transporter related  32.95 
 
 		 603 aa  203  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  31.36 
 
 		 659 aa  203  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0972  ABC transporter related  33.72 
 
 		 626 aa  203  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066159 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  31.24 
 
 		 636 aa  202  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 		 545 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  30.94 
 
 		 638 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34 
 
 		 550 aa  200  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  29.74 
 
 		 634 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  29.21 
 
 		 638 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>