More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1888 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  100 
 
 		 545 aa  1077    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  59.39 
 
 		 535 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  57.36 
 
 		 527 aa  554  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  54.11 
 
 		 531 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  56.6 
 
 		 527 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  52.77 
 
 		 530 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  52.37 
 
 		 534 aa  465  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  50.57 
 
 		 531 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  48.85 
 
 		 524 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  50.1 
 
 		 525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  47.43 
 
 		 533 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  46.67 
 
 		 526 aa  435  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  48.85 
 
 		 532 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  50.29 
 
 		 534 aa  415  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 		 524 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  36.26 
 
 		 534 aa  345  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  39.89 
 
 		 541 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  40.3 
 
 		 544 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.33 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  40.08 
 
 		 537 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  40.08 
 
 		 537 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  40.08 
 
 		 537 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  39.31 
 
 		 541 aa  299  7e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  38.26 
 
 		 535 aa  299  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  38.59 
 
 		 554 aa  297  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  38.55 
 
 		 539 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  39.35 
 
 		 553 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  39.77 
 
 		 549 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 536 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  39.88 
 
 		 511 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  39.66 
 
 		 557 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  40.5 
 
 		 565 aa  276  7e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  36.55 
 
 		 548 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  36.53 
 
 		 551 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  36.53 
 
 		 551 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.36 
 
 		 548 aa  269  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.58 
 
 		 538 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  35.35 
 
 		 530 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  36.98 
 
 		 550 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  29.94 
 
 		 529 aa  263  4.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  35.62 
 
 		 558 aa  263  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  37.91 
 
 		 532 aa  263  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 		 548 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 		 548 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 		 548 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 		 548 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 		 548 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 		 548 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  36.4 
 
 		 546 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 		 548 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  34.51 
 
 		 548 aa  260  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  36.55 
 
 		 516 aa  259  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  36.29 
 
 		 553 aa  257  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  31.89 
 
 		 529 aa  257  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  37.19 
 
 		 535 aa  256  8e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  35.54 
 
 		 555 aa  256  9e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  36.63 
 
 		 546 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.75 
 
 		 531 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  34.64 
 
 		 531 aa  251  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  30.51 
 
 		 528 aa  251  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  30.78 
 
 		 529 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  34.47 
 
 		 541 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  36.35 
 
 		 535 aa  242  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  28.46 
 
 		 529 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  35.96 
 
 		 525 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  36.31 
 
 		 530 aa  234  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  29.83 
 
 		 530 aa  233  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  35.01 
 
 		 525 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  26.68 
 
 		 639 aa  219  7e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  30.13 
 
 		 668 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  31.59 
 
 		 767 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  36.26 
 
 		 628 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  35.94 
 
 		 628 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  29.79 
 
 		 643 aa  215  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  33.2 
 
 		 626 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  33.03 
 
 		 649 aa  214  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  32.7 
 
 		 642 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  29.56 
 
 		 519 aa  213  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  34.18 
 
 		 631 aa  211  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  26.88 
 
 		 634 aa  211  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  33.27 
 
 		 619 aa  211  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  30.41 
 
 		 523 aa  211  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  34.19 
 
 		 659 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  32.14 
 
 		 615 aa  209  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  32.14 
 
 		 615 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  30.27 
 
 		 643 aa  207  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  30.08 
 
 		 606 aa  207  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.04 
 
 		 641 aa  207  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4771  ABC transporter related  34.1 
 
 		 635 aa  206  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0571  ABC transporter, ATP-binding protein  29.75 
 
 		 645 aa  206  1e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.940937  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  28.04 
 
 		 634 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  33.33 
 
 		 633 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  30.91 
 
 		 636 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  32.91 
 
 		 659 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.11 
 
 		 644 aa  204  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  31.95 
 
 		 632 aa  204  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  34.34 
 
 		 618 aa  203  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  29.39 
 
 		 643 aa  203  6e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  33.4 
 
 		 629 aa  203  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>