More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1233 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  51.52 
 
 		 649 aa  657    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  57.99 
 
 		 632 aa  704    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  100 
 
 		 659 aa  1330    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  81.54 
 
 		 659 aa  1014    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  38.36 
 
 		 636 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  35.89 
 
 		 634 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  39.37 
 
 		 641 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  36.17 
 
 		 644 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  38.77 
 
 		 644 aa  429  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  36.36 
 
 		 645 aa  429  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  36.57 
 
 		 658 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  36.57 
 
 		 658 aa  423  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  36.46 
 
 		 658 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  36.46 
 
 		 658 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 		 659 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  36.61 
 
 		 640 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 636 aa  421  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 		 644 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 662 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  36.25 
 
 		 659 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  39.58 
 
 		 620 aa  412  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  35.44 
 
 		 658 aa  411  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  34.98 
 
 		 639 aa  411  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  35.96 
 
 		 649 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  36.21 
 
 		 635 aa  404  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  35.34 
 
 		 638 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 638 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  36.57 
 
 		 640 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  37.97 
 
 		 634 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  38.4 
 
 		 767 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  36.8 
 
 		 645 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  35.84 
 
 		 636 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  33.98 
 
 		 630 aa  389  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  32.84 
 
 		 644 aa  387  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  33.83 
 
 		 642 aa  389  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  33.83 
 
 		 642 aa  389  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  34.62 
 
 		 638 aa  386  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  36.56 
 
 		 645 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  34.35 
 
 		 666 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  33.99 
 
 		 646 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  33.86 
 
 		 639 aa  382  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  36.03 
 
 		 668 aa  380  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  32.23 
 
 		 643 aa  382  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  34.67 
 
 		 649 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  34.92 
 
 		 663 aa  377  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  36.57 
 
 		 663 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  36.16 
 
 		 648 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  34.5 
 
 		 667 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  37.69 
 
 		 672 aa  374  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  34.81 
 
 		 685 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  35.12 
 
 		 648 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  35.29 
 
 		 641 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  35.3 
 
 		 643 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 		 632 aa  369  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 		 643 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  33.9 
 
 		 641 aa  365  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  34.33 
 
 		 656 aa  365  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  38.71 
 
 		 544 aa  365  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  38.84 
 
 		 575 aa  364  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  34.93 
 
 		 651 aa  363  6e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  36.74 
 
 		 650 aa  363  6e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  34.19 
 
 		 652 aa  362  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  38.29 
 
 		 653 aa  360  5e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  35.87 
 
 		 657 aa  360  6e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  32.7 
 
 		 630 aa  360  6e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  36.1 
 
 		 690 aa  360  7e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  39 
 
 		 709 aa  358  1.9999999999999998e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  33.63 
 
 		 656 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  38.6 
 
 		 564 aa  357  5.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  30.39 
 
 		 627 aa  356  6.999999999999999e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 		 545 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  40.99 
 
 		 569 aa  355  1e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.48 
 
 		 645 aa  355  2e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  37.57 
 
 		 543 aa  355  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  37.39 
 
 		 540 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  37.75 
 
 		 540 aa  353  5e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  39.04 
 
 		 542 aa  353  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  34.39 
 
 		 650 aa  353  7e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  37.68 
 
 		 581 aa  350  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  37.08 
 
 		 543 aa  350  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0204  ABC transporter, ATP-binding protein  35.44 
 
 		 626 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2379  ABC transporter related  37.01 
 
 		 660 aa  348  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  34.79 
 
 		 652 aa  348  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  34.12 
 
 		 541 aa  348  2e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4548  ABC transporter related protein  35.75 
 
 		 644 aa  347  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  39.71 
 
 		 567 aa  347  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0217  ABC transporter ATP-binding protein  35.28 
 
 		 626 aa  346  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0228  ABC transporter ATP-binding protein  35.28 
 
 		 626 aa  346  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  37 
 
 		 549 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  33.75 
 
 		 541 aa  345  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0245  ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 626 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  34.85 
 
 		 535 aa  343  5e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  33.38 
 
 		 641 aa  343  7e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  34.47 
 
 		 659 aa  342  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0262  ABC transporter, ATP-binding protein  34.87 
 
 		 626 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0238  ABC transporter, ATP-binding protein  34.97 
 
 		 626 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  33.99 
 
 		 536 aa  340  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5082  ABC transporter, ATP-binding protein  34.18 
 
 		 626 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0119916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  36.49 
 
 		 540 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  36.49 
 
 		 540 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>