More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2125 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  100 
 
 
659 aa  1345    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 
663 aa  414  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 
663 aa  415  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  38.07 
 
 
646 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  36.54 
 
 
685 aa  412  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  38.91 
 
 
638 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  39.65 
 
 
636 aa  405  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  37.71 
 
 
633 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  37.15 
 
 
657 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  35.99 
 
 
668 aa  400  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  37.37 
 
 
639 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  35.53 
 
 
690 aa  395  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  38.45 
 
 
643 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  37.09 
 
 
650 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 
638 aa  395  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  36.83 
 
 
643 aa  395  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 
637 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.7 
 
 
637 aa  395  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  37.87 
 
 
656 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  38.15 
 
 
659 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.6 
 
 
637 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  37.46 
 
 
643 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 
637 aa  391  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  36.18 
 
 
637 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  36.18 
 
 
637 aa  391  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  35.62 
 
 
672 aa  392  1e-107  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  37.56 
 
 
625 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 
637 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 
637 aa  392  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 
637 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.81 
 
 
635 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 
637 aa  391  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  36.18 
 
 
637 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  38.09 
 
 
625 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  37.33 
 
 
637 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  37.33 
 
 
637 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  37.33 
 
 
637 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  37.52 
 
 
637 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.66 
 
 
635 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  37.17 
 
 
637 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  38.76 
 
 
636 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.24 
 
 
640 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.09 
 
 
640 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.24 
 
 
640 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  37.6 
 
 
637 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.66 
 
 
635 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  37.6 
 
 
637 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 
635 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  37.15 
 
 
633 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0112  ABC transporter related  38.59 
 
 
650 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.339786  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.81 
 
 
635 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.66 
 
 
635 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  37.44 
 
 
637 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  36.54 
 
 
646 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  37.16 
 
 
625 aa  385  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  37.74 
 
 
640 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  34.72 
 
 
630 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  36.64 
 
 
667 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.79 
 
 
639 aa  382  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1572  ABC transporter, ATP-binding protein  38.45 
 
 
646 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.50284  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  40.95 
 
 
535 aa  381  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  39.69 
 
 
709 aa  382  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2075  ABC transporter, ATP-binding protein  38.45 
 
 
646 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.491633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2455  ABC transporter, ATP-binding protein  38.45 
 
 
646 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242369  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.17 
 
 
635 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2600  ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 
646 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0562857  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3237  ABC transporter, ATP-binding protein  38.45 
 
 
646 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2511  ABC transporter, ATP-binding protein  38.45 
 
 
646 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.271255  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  37.48 
 
 
636 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1347  ABC transporter, ATP-binding protein  38.45 
 
 
646 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6041  ABC transporter related  38.45 
 
 
643 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2055  ABC transporter related  38.45 
 
 
643 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.035925  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2036  ABC transporter related  38.45 
 
 
643 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252943  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2071  ABC transporter related  37.54 
 
 
656 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.144058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  37.46 
 
 
641 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  40.93 
 
 
548 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1894  ABC transporter related  37.24 
 
 
656 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  38.44 
 
 
633 aa  379  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1761  ABC transporter related  35.76 
 
 
647 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  35.89 
 
 
636 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  40.56 
 
 
540 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  32.58 
 
 
643 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2068  ABC transporter related  38.15 
 
 
643 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  36.09 
 
 
650 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  37.62 
 
 
615 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 
651 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  39.44 
 
 
564 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  36.69 
 
 
615 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5345  ABC transporter, fused ATPase subunits  39.06 
 
 
643 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  36.69 
 
 
615 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  37.05 
 
 
645 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  37.46 
 
 
636 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  36.63 
 
 
642 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  37.79 
 
 
615 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  35.17 
 
 
688 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  39 
 
 
545 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
632 aa  373  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1937  ABC transporter related  38.72 
 
 
628 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.832952 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2041  ABC transporter related  36.35 
 
 
651 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  40.37 
 
 
564 aa  372  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>