More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1761 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2203  ABC transporter related  50.15 
 
 		 669 aa  650    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0324  ABC transporter related  54.6 
 
 		 659 aa  699    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.843371  normal  0.526275 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1761  ABC transporter related  100 
 
 		 647 aa  1325    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1101  ABC transporter related  55.57 
 
 		 658 aa  654    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0871053  normal  0.0818517 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0250  ATPase  54.15 
 
 		 662 aa  710    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2379  ABC transporter related  54.09 
 
 		 660 aa  719    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 		 663 aa  402  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  36.57 
 
 		 663 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  36.35 
 
 		 685 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  35.69 
 
 		 638 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  35.21 
 
 		 668 aa  378  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  35.76 
 
 		 659 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.93 
 
 		 635 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  34.12 
 
 		 690 aa  372  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  33.85 
 
 		 672 aa  369  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 637 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.76 
 
 		 635 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 		 639 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.24 
 
 		 635 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.24 
 
 		 635 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 637 aa  364  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.38 
 
 		 635 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 		 635 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  36.05 
 
 		 637 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  36.05 
 
 		 637 aa  363  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 637 aa  363  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 637 aa  363  4e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 		 635 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.09 
 
 		 637 aa  363  4e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  36.05 
 
 		 637 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 637 aa  363  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 637 aa  363  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  33.94 
 
 		 648 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.35 
 
 		 640 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.35 
 
 		 640 aa  357  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.35 
 
 		 640 aa  357  5e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.73 
 
 		 637 aa  356  7.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.88 
 
 		 634 aa  354  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  33.28 
 
 		 646 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  38.57 
 
 		 709 aa  353  5.9999999999999994e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  35.02 
 
 		 636 aa  351  3e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  37.64 
 
 		 549 aa  350  5e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0112  ABC transporter related  36.32 
 
 		 650 aa  349  9e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.339786  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0405  ABC transporter related protein  35.7 
 
 		 658 aa  349  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 641 aa  349  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  36.05 
 
 		 644 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  38.18 
 
 		 633 aa  348  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  36.25 
 
 		 560 aa  348  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  35.62 
 
 		 638 aa  347  4e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  36.01 
 
 		 624 aa  347  5e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  34.6 
 
 		 627 aa  347  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 634 aa  346  8.999999999999999e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  36.47 
 
 		 635 aa  345  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  36.17 
 
 		 672 aa  345  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 		 659 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  34.52 
 
 		 658 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  34.1 
 
 		 627 aa  345  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  36.75 
 
 		 542 aa  345  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  34.98 
 
 		 659 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 		 658 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  36.01 
 
 		 543 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  34.51 
 
 		 640 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  36.46 
 
 		 636 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  34.52 
 
 		 658 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  34.52 
 
 		 658 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  36.63 
 
 		 637 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  35.61 
 
 		 637 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  35.61 
 
 		 637 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  35.7 
 
 		 540 aa  343  5e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  35.7 
 
 		 540 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  34.1 
 
 		 651 aa  342  9e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  34.35 
 
 		 638 aa  342  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  35.61 
 
 		 637 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  35.56 
 
 		 637 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  35.56 
 
 		 637 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  35.56 
 
 		 637 aa  340  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  35.74 
 
 		 633 aa  340  5e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  36.1 
 
 		 636 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  34.52 
 
 		 658 aa  340  7e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  35.47 
 
 		 656 aa  339  8e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  33.08 
 
 		 656 aa  339  8e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  36.03 
 
 		 637 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0048  ABC transporter related  32.69 
 
 		 664 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  34.71 
 
 		 641 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 644 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  36.02 
 
 		 636 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.83 
 
 		 548 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  35.88 
 
 		 548 aa  337  5e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  34.76 
 
 		 540 aa  337  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  34.39 
 
 		 545 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  35.05 
 
 		 619 aa  336  7e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  36.55 
 
 		 636 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  34.73 
 
 		 543 aa  336  9e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  34.1 
 
 		 644 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  37.12 
 
 		 564 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  35.7 
 
 		 548 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.2 
 
 		 541 aa  335  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  34.59 
 
 		 645 aa  335  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  30.61 
 
 		 688 aa  334  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  35.56 
 
 		 643 aa  335  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>