More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6057 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  100 
 
 		 688 aa  1385    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0878  ABC transporter related  42.72 
 
 		 694 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.0940441 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0830  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  46.06 
 
 		 673 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0876  ABC transporter-related protein  49.26 
 
 		 673 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0880  ABC transporter related  49.63 
 
 		 673 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  39.15 
 
 		 668 aa  462  1e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  37.08 
 
 		 663 aa  463  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 		 663 aa  462  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  40.49 
 
 		 690 aa  461  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  37.89 
 
 		 685 aa  458  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  40.7 
 
 		 649 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  39.67 
 
 		 709 aa  440  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 645 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  38.64 
 
 		 649 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  37.79 
 
 		 672 aa  435  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  39.87 
 
 		 641 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  38.19 
 
 		 619 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  39.51 
 
 		 540 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  41.87 
 
 		 645 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  39.51 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  39.32 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  34.02 
 
 		 646 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  40.1 
 
 		 648 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.51 
 
 		 645 aa  402  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  37.84 
 
 		 540 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  39.84 
 
 		 648 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  38.79 
 
 		 540 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  39.29 
 
 		 545 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  33.24 
 
 		 632 aa  401  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  36.02 
 
 		 667 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  39.63 
 
 		 549 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  38.24 
 
 		 539 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  37.09 
 
 		 544 aa  396  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.98 
 
 		 541 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  33.82 
 
 		 656 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  38.05 
 
 		 540 aa  395  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  38.85 
 
 		 641 aa  395  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  38.6 
 
 		 540 aa  395  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  37.06 
 
 		 545 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  32.64 
 
 		 630 aa  391  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  38.65 
 
 		 545 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  37.68 
 
 		 540 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  33.53 
 
 		 643 aa  391  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  36.42 
 
 		 767 aa  391  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  37.13 
 
 		 540 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  38.19 
 
 		 548 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  37.5 
 
 		 540 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  36.18 
 
 		 664 aa  391  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  37.57 
 
 		 560 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  37.85 
 
 		 535 aa  388  1e-106  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  36.88 
 
 		 540 aa  388  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  36.7 
 
 		 540 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  38.43 
 
 		 548 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  33.09 
 
 		 638 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0405  ABC transporter related protein  34.91 
 
 		 658 aa  383  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224406  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  36.51 
 
 		 540 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  38.13 
 
 		 565 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  38.07 
 
 		 548 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  37.96 
 
 		 542 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  37.78 
 
 		 540 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 545 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  38.62 
 
 		 540 aa  382  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  35.36 
 
 		 659 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  38.49 
 
 		 544 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 		 637 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3136  ABC transporter related  34.25 
 
 		 644 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  35.25 
 
 		 636 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  33.43 
 
 		 651 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  38.05 
 
 		 540 aa  375  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.24 
 
 		 637 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.99 
 
 		 639 aa  372  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  37.43 
 
 		 540 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  37.8 
 
 		 642 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  32.65 
 
 		 637 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  38.21 
 
 		 536 aa  372  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  32.8 
 
 		 648 aa  369  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  37.59 
 
 		 564 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  36.88 
 
 		 540 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  33.97 
 
 		 650 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 		 546 aa  368  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  37.75 
 
 		 543 aa  369  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  36.11 
 
 		 615 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  37.11 
 
 		 575 aa  365  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.22 
 
 		 640 aa  365  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.08 
 
 		 640 aa  365  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.22 
 
 		 640 aa  365  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  36.78 
 
 		 543 aa  362  9e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.69 
 
 		 635 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.66 
 
 		 635 aa  362  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  34.9 
 
 		 624 aa  362  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  32.64 
 
 		 659 aa  362  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2203  ABC transporter related  35.06 
 
 		 669 aa  361  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  36.54 
 
 		 656 aa  360  3e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.54 
 
 		 635 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.54 
 
 		 635 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  33.19 
 
 		 615 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  35.34 
 
 		 581 aa  359  9e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  33.24 
 
 		 642 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  32.7 
 
 		 615 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  31.63 
 
 		 638 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>