More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_200 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  98.04 
 
 		 663 aa  1328    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 663 aa  1350    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  92.31 
 
 		 685 aa  1248    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  42.99 
 
 		 668 aa  556  1e-157  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  41.37 
 
 		 690 aa  543  1e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  43.35 
 
 		 672 aa  543  1e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  41.28 
 
 		 709 aa  533  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  39.29 
 
 		 667 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  43.73 
 
 		 549 aa  491  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  42.06 
 
 		 641 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  41.58 
 
 		 645 aa  485  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  41.27 
 
 		 645 aa  480  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  43.45 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  39.3 
 
 		 649 aa  474  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  42.43 
 
 		 544 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  39.3 
 
 		 646 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 		 632 aa  467  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 545 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  40.55 
 
 		 638 aa  465  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  42.43 
 
 		 543 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  39.94 
 
 		 649 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  42.32 
 
 		 540 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  41.67 
 
 		 543 aa  458  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  40.74 
 
 		 648 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  40.58 
 
 		 648 aa  459  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  41.91 
 
 		 767 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  42.16 
 
 		 560 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  42.51 
 
 		 540 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  41.95 
 
 		 542 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  44.72 
 
 		 536 aa  452  1e-125  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  42.05 
 
 		 540 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  41.32 
 
 		 619 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 656 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  40.91 
 
 		 540 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  40.91 
 
 		 540 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  36.78 
 
 		 688 aa  442  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  40.91 
 
 		 540 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  40.91 
 
 		 540 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 540 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.97 
 
 		 541 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  41.1 
 
 		 540 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  43.29 
 
 		 535 aa  437  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  41.67 
 
 		 540 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  38.35 
 
 		 641 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  41.67 
 
 		 540 aa  438  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  38.57 
 
 		 651 aa  432  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  41.67 
 
 		 540 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  41.21 
 
 		 565 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  40.91 
 
 		 540 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  41.24 
 
 		 564 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  40.28 
 
 		 642 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  41.1 
 
 		 540 aa  430  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  40.34 
 
 		 548 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  41.67 
 
 		 540 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  40.91 
 
 		 540 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  37.86 
 
 		 652 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  41.29 
 
 		 539 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  40.15 
 
 		 548 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  37.21 
 
 		 643 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  40.72 
 
 		 540 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  40.15 
 
 		 548 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  39.77 
 
 		 545 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  40.49 
 
 		 581 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  36.06 
 
 		 664 aa  422  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  38.28 
 
 		 653 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  40.57 
 
 		 567 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  40.34 
 
 		 540 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  38.05 
 
 		 652 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  41.28 
 
 		 637 aa  415  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  37.76 
 
 		 630 aa  414  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  37.14 
 
 		 667 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  37.1 
 
 		 659 aa  415  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  35.39 
 
 		 644 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  37.08 
 
 		 650 aa  411  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  40.3 
 
 		 575 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  37.63 
 
 		 650 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  36.97 
 
 		 656 aa  404  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  41.98 
 
 		 569 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  35.44 
 
 		 659 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  36.63 
 
 		 666 aa  403  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  39.81 
 
 		 564 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0876  ABC transporter-related protein  40.44 
 
 		 673 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1761  ABC transporter related  36.57 
 
 		 647 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  34.01 
 
 		 643 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  35.03 
 
 		 658 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  35.23 
 
 		 659 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0880  ABC transporter related  40.44 
 
 		 673 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.75 
 
 		 645 aa  394  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  34.66 
 
 		 662 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  34.88 
 
 		 658 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 658 aa  395  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0878  ABC transporter related  36.3 
 
 		 694 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.0940441 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  41.12 
 
 		 574 aa  395  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0250  ATPase  34.92 
 
 		 662 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  34.88 
 
 		 640 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0830  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  37.3 
 
 		 673 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 658 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  34.66 
 
 		 644 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  34.16 
 
 		 658 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  34.29 
 
 		 648 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>