More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2170 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  100 
 
 		 645 aa  1283    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  49.77 
 
 		 627 aa  629  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  54.63 
 
 		 615 aa  626  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  51.89 
 
 		 627 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  51.48 
 
 		 637 aa  618  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  51.89 
 
 		 627 aa  621  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  52.43 
 
 		 625 aa  616  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 627 aa  608  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  51.8 
 
 		 625 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 640 aa  608  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  51.26 
 
 		 642 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  51.65 
 
 		 625 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  51.8 
 
 		 629 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  51.26 
 
 		 615 aa  601  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  50.94 
 
 		 615 aa  601  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  50.47 
 
 		 633 aa  601  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.3 
 
 		 639 aa  598  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  54.92 
 
 		 621 aa  592  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2317  ABC transporter related  51.33 
 
 		 627 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0238  ABC transporter related  55.11 
 
 		 625 aa  587  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.773221  normal  0.692019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2484  ABC transporter related  52.12 
 
 		 625 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  51.94 
 
 		 622 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.551802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  54.38 
 
 		 620 aa  579  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2428  ABC transporter related  49.45 
 
 		 625 aa  579  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1348  ABC transporter related  50.78 
 
 		 625 aa  581  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  51.82 
 
 		 625 aa  579  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  54.21 
 
 		 621 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  54.21 
 
 		 621 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2962  ABC transporter related  51.82 
 
 		 619 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0574525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0972  ABC transporter related  50 
 
 		 626 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6573  ABC transporter related  55.09 
 
 		 623 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902465 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  49.92 
 
 		 618 aa  569  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  50 
 
 		 615 aa  560  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  47.72 
 
 		 627 aa  558  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3118  ABC transporter related  51.34 
 
 		 631 aa  561  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1232  ABC transporter related  50.63 
 
 		 626 aa  560  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.072507  normal  0.215663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6763  ABC transporter related  53.59 
 
 		 623 aa  558  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1310  ABC transporter related  53.17 
 
 		 622 aa  554  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142081  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3480  ABC transporter related  48.52 
 
 		 634 aa  550  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549576 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0572  ABC transporter related  45.79 
 
 		 628 aa  546  1e-154  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.2 
 
 		 635 aa  530  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.13 
 
 		 635 aa  531  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.48 
 
 		 640 aa  528  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.61 
 
 		 639 aa  527  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.48 
 
 		 640 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.67 
 
 		 637 aa  528  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.48 
 
 		 640 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2537  ABC transporter related  48.25 
 
 		 627 aa  522  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.265447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.38 
 
 		 637 aa  522  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  46.17 
 
 		 634 aa  520  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 635 aa  519  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  44.83 
 
 		 637 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  44.83 
 
 		 637 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 		 637 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 		 637 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 		 637 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  44.83 
 
 		 637 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.04 
 
 		 635 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 		 637 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 		 637 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 		 637 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.04 
 
 		 635 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.04 
 
 		 635 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  46 
 
 		 636 aa  515  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.04 
 
 		 635 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.04 
 
 		 635 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  44.43 
 
 		 639 aa  502  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  43.1 
 
 		 637 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  43.1 
 
 		 637 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  44.62 
 
 		 659 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  43.1 
 
 		 637 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3178  ABC transporter related  43.8 
 
 		 650 aa  499  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  44.2 
 
 		 637 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  44.2 
 
 		 637 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  43.89 
 
 		 636 aa  501  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  44.13 
 
 		 636 aa  501  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  43.1 
 
 		 636 aa  497  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  42.95 
 
 		 637 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.57 
 
 		 634 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  44.04 
 
 		 637 aa  497  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  43.86 
 
 		 657 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 643 aa  489  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 637 aa  491  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  43.39 
 
 		 656 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0048  ABC transporter related  40.87 
 
 		 664 aa  488  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  43.86 
 
 		 636 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0904  ABC transporter related  49.33 
 
 		 527 aa  486  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467195  decreased coverage  0.00659199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  42.55 
 
 		 648 aa  488  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  42.72 
 
 		 646 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  41.4 
 
 		 636 aa  480  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  45.73 
 
 		 642 aa  476  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 		 638 aa  476  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 		 638 aa  474  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  44.22 
 
 		 635 aa  475  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0112  ABC transporter related  42.79 
 
 		 650 aa  473  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.339786  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2171  ABC transporter related  49.91 
 
 		 542 aa  472  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  42.75 
 
 		 643 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  42.25 
 
 		 633 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3136  ABC transporter related  43.86 
 
 		 644 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1894  ABC transporter related  42.84 
 
 		 656 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>