More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2171 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2537  ABC transporter related  75.47 
 
 		 627 aa  771    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.265447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2171  ABC transporter related  100 
 
 		 542 aa  1086    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  54.14 
 
 		 627 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  56.93 
 
 		 621 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  54.14 
 
 		 627 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  57.23 
 
 		 615 aa  573  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  54.95 
 
 		 621 aa  565  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  54.89 
 
 		 633 aa  567  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  54.95 
 
 		 621 aa  565  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  53.6 
 
 		 629 aa  558  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  53.63 
 
 		 627 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0972  ABC transporter related  56.27 
 
 		 626 aa  556  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  54.41 
 
 		 615 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  54.21 
 
 		 620 aa  557  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  54.11 
 
 		 637 aa  557  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  54.41 
 
 		 615 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2428  ABC transporter related  54.56 
 
 		 625 aa  553  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  54.21 
 
 		 642 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.64 
 
 		 639 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6763  ABC transporter related  56.12 
 
 		 623 aa  548  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6573  ABC transporter related  58.3 
 
 		 623 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902465 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  55.56 
 
 		 618 aa  547  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  54.86 
 
 		 625 aa  547  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  53.44 
 
 		 625 aa  543  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  51.91 
 
 		 627 aa  541  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  52.14 
 
 		 625 aa  542  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  53.03 
 
 		 622 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.551802 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1232  ABC transporter related  52.89 
 
 		 626 aa  533  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.072507  normal  0.215663 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  52.08 
 
 		 640 aa  529  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  53.8 
 
 		 615 aa  530  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  51.89 
 
 		 627 aa  527  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  50.67 
 
 		 625 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  52.2 
 
 		 645 aa  522  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2317  ABC transporter related  51.04 
 
 		 627 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2484  ABC transporter related  49.64 
 
 		 625 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2962  ABC transporter related  50.09 
 
 		 619 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0574525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0904  ABC transporter related  51.34 
 
 		 527 aa  502  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467195  decreased coverage  0.00659199 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1348  ABC transporter related  50.46 
 
 		 625 aa  491  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3118  ABC transporter related  51.14 
 
 		 631 aa  489  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3480  ABC transporter related  50.29 
 
 		 634 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0238  ABC transporter related  53.5 
 
 		 625 aa  479  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.773221  normal  0.692019 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1310  ABC transporter related  50.93 
 
 		 622 aa  463  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  45.31 
 
 		 636 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0572  ABC transporter related  45.34 
 
 		 628 aa  433  1e-120  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.4 
 
 		 635 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  45.56 
 
 		 635 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 		 635 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 		 635 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.4 
 
 		 635 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.01 
 
 		 637 aa  424  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.01 
 
 		 637 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  43.01 
 
 		 637 aa  424  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 		 635 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.99 
 
 		 637 aa  425  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.01 
 
 		 637 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  43.01 
 
 		 637 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.01 
 
 		 637 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  43.93 
 
 		 659 aa  423  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.01 
 
 		 637 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 637 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  43.44 
 
 		 624 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.83 
 
 		 637 aa  421  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1759  ABC transporter-related protein  43.96 
 
 		 554 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.656937  normal  0.0503302 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  43.93 
 
 		 639 aa  422  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  40.23 
 
 		 532 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  40.23 
 
 		 532 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.31 
 
 		 635 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.58 
 
 		 639 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.51 
 
 		 640 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01943  ABC transporter ATP-binding protein  42.96 
 
 		 630 aa  415  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 		 637 aa  415  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  43.5 
 
 		 633 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.51 
 
 		 640 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.51 
 
 		 640 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  45.89 
 
 		 672 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  43.99 
 
 		 638 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  43.09 
 
 		 634 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 		 635 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3138  ABC transporter related  44.84 
 
 		 621 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00577211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 		 634 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  45.54 
 
 		 642 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  44.69 
 
 		 636 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0037  ABC transporter ATPase  41.75 
 
 		 672 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.489009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  41.96 
 
 		 643 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0279  ABC transporter related  41.26 
 
 		 673 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3856  ABC transporter related  43.22 
 
 		 559 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0045  ABC transporter related  41.56 
 
 		 663 aa  404  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.919141  normal  0.873152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0433  ABC transporter, ATP-binding protein  43.91 
 
 		 641 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  43.22 
 
 		 636 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  43.25 
 
 		 643 aa  401  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  42.75 
 
 		 643 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  43.56 
 
 		 640 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  44.75 
 
 		 633 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2480  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 676 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  43.96 
 
 		 637 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  43.96 
 
 		 637 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  43.96 
 
 		 637 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  43.99 
 
 		 636 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3608  ABC transporter related  42.09 
 
 		 687 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100909  normal  0.0123712 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7151  ABC transporter related  44.15 
 
 		 554 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.478249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>