More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0238 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  55.49 
 
 
645 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0238  ABC transporter related  100 
 
 
625 aa  1216    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.773221  normal  0.692019 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1310  ABC transporter related  64.91 
 
 
622 aa  709    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142081  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  51.83 
 
 
627 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  51.2 
 
 
627 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.8 
 
 
639 aa  605  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  51.53 
 
 
633 aa  607  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  52.24 
 
 
642 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  53.05 
 
 
629 aa  601  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  52.01 
 
 
615 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  52.01 
 
 
615 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  49.2 
 
 
627 aa  597  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  49.84 
 
 
627 aa  590  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  50.55 
 
 
637 aa  587  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  49.37 
 
 
640 aa  588  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  53.01 
 
 
615 aa  580  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  53.25 
 
 
621 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  50.55 
 
 
625 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  50.08 
 
 
627 aa  574  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1348  ABC transporter related  51.28 
 
 
625 aa  567  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  52.33 
 
 
621 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  52.33 
 
 
621 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  48.4 
 
 
625 aa  559  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  50.4 
 
 
618 aa  555  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  52.16 
 
 
620 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  48.97 
 
 
625 aa  553  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6573  ABC transporter related  52.96 
 
 
623 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00902465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6763  ABC transporter related  53.42 
 
 
623 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  48.31 
 
 
625 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  50.16 
 
 
615 aa  550  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2484  ABC transporter related  49.04 
 
 
625 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814906  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2428  ABC transporter related  48.72 
 
 
625 aa  544  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0972  ABC transporter related  49.59 
 
 
626 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  45.31 
 
 
637 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  45.31 
 
 
637 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 
637 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 
637 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 
637 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 
637 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 
637 aa  537  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 
637 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2962  ABC transporter related  48.47 
 
 
619 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0574525  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  45.31 
 
 
637 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.6 
 
 
635 aa  534  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  49.83 
 
 
622 aa  535  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.551802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3480  ABC transporter related  48.9 
 
 
634 aa  531  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
639 aa  526  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 
635 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2317  ABC transporter related  47.38 
 
 
627 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359814  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3118  ABC transporter related  52.13 
 
 
631 aa  528  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 
635 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.81 
 
 
635 aa  523  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 
635 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 
640 aa  522  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 
640 aa  522  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 
635 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.88 
 
 
637 aa  521  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 
640 aa  521  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.53 
 
 
637 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1232  ABC transporter related  50.59 
 
 
626 aa  520  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.072507  normal  0.215663 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 
635 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  44.34 
 
 
636 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  44.02 
 
 
637 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  44.02 
 
 
637 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  44.84 
 
 
656 aa  514  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  43.6 
 
 
638 aa  513  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  45.44 
 
 
636 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  44.02 
 
 
637 aa  515  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  43.86 
 
 
637 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  44.89 
 
 
636 aa  508  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 
634 aa  509  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  44.23 
 
 
637 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  44.23 
 
 
637 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  44.43 
 
 
637 aa  510  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  41.73 
 
 
638 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  44.43 
 
 
637 aa  503  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  44.79 
 
 
635 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2537  ABC transporter related  47.61 
 
 
627 aa  503  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.265447  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  44.5 
 
 
657 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  42.14 
 
 
639 aa  498  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  43.13 
 
 
659 aa  497  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  44.28 
 
 
636 aa  498  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3178  ABC transporter related  44.15 
 
 
650 aa  497  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  45.77 
 
 
672 aa  498  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  41.56 
 
 
643 aa  494  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0572  ABC transporter related  43.46 
 
 
628 aa  494  9.999999999999999e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  47.36 
 
 
633 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  46.18 
 
 
642 aa  487  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  43.33 
 
 
635 aa  482  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  45.03 
 
 
624 aa  484  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  44.53 
 
 
636 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  42.11 
 
 
633 aa  482  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  42.77 
 
 
636 aa  482  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  45.59 
 
 
634 aa  480  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0433  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 
641 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2171  ABC transporter related  52.4 
 
 
542 aa  474  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  42.38 
 
 
635 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  44.22 
 
 
636 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  42.26 
 
 
648 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0048  ABC transporter related  38.61 
 
 
664 aa  475  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>