More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1024 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  57.3 
 
 
638 aa  635    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  100 
 
 
535 aa  1101    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  61.35 
 
 
656 aa  666    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  61.17 
 
 
632 aa  692    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  60.42 
 
 
646 aa  663    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  54.58 
 
 
667 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  44.07 
 
 
630 aa  456  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  44.15 
 
 
641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  40.87 
 
 
668 aa  439  9.999999999999999e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 
663 aa  438  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  43.29 
 
 
663 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.74 
 
 
645 aa  432  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  42.53 
 
 
685 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  41.21 
 
 
672 aa  428  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  43.32 
 
 
653 aa  424  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  42.49 
 
 
564 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  41.14 
 
 
690 aa  421  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  40.37 
 
 
667 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  41.25 
 
 
637 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  39.31 
 
 
544 aa  418  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  40.9 
 
 
643 aa  415  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  41.62 
 
 
581 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  41.97 
 
 
767 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  41.46 
 
 
656 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  40.19 
 
 
641 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  37.85 
 
 
664 aa  405  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  41.47 
 
 
652 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  41.73 
 
 
652 aa  405  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 
645 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  42.69 
 
 
567 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  40.38 
 
 
645 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  38.42 
 
 
545 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  39.68 
 
 
709 aa  399  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  40.85 
 
 
650 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  37.52 
 
 
545 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  39.31 
 
 
546 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  41.5 
 
 
575 aa  399  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  39.81 
 
 
649 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  41.5 
 
 
651 aa  398  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  40.04 
 
 
650 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  40.64 
 
 
569 aa  395  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  38.83 
 
 
548 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  38.83 
 
 
548 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  41.7 
 
 
564 aa  395  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  37.85 
 
 
545 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  40.56 
 
 
644 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  38.64 
 
 
548 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  41.5 
 
 
641 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  42.29 
 
 
642 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  36.72 
 
 
540 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  36.75 
 
 
540 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  42.05 
 
 
641 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  36.7 
 
 
542 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  36.82 
 
 
543 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  40.38 
 
 
648 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  36.91 
 
 
540 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  35.82 
 
 
540 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  35.97 
 
 
540 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  35.7 
 
 
549 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  36.72 
 
 
544 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  36.38 
 
 
540 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  39.74 
 
 
649 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  35.97 
 
 
540 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  35.86 
 
 
540 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  36.45 
 
 
540 aa  382  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  37.59 
 
 
634 aa  382  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  35.73 
 
 
560 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  36.52 
 
 
543 aa  382  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  35.92 
 
 
540 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  36.4 
 
 
540 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  35.63 
 
 
540 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  40.95 
 
 
659 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  40.19 
 
 
648 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.78 
 
 
541 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  35.33 
 
 
636 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  35.16 
 
 
540 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  36.81 
 
 
688 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  36.67 
 
 
540 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  36.29 
 
 
565 aa  379  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  38.68 
 
 
536 aa  377  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  36.15 
 
 
539 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  36.38 
 
 
545 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  35.32 
 
 
540 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  40.77 
 
 
574 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  37.36 
 
 
645 aa  375  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  35.78 
 
 
540 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  36.82 
 
 
639 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  33.52 
 
 
637 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  33.52 
 
 
637 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  33.52 
 
 
637 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 
637 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 
637 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  35.92 
 
 
540 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.9 
 
 
635 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 
637 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 
637 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.9 
 
 
635 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.9 
 
 
635 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.9 
 
 
635 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 
637 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>