More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2216 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  61.06 
 
 		 646 aa  820    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  61.17 
 
 		 535 aa  692    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  50.45 
 
 		 667 aa  642    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 632 aa  1301    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  56.28 
 
 		 638 aa  725    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  60.7 
 
 		 656 aa  803    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  40.25 
 
 		 630 aa  483  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  39.14 
 
 		 663 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 		 663 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  39.07 
 
 		 672 aa  461  9.999999999999999e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  39.02 
 
 		 637 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  38.69 
 
 		 685 aa  458  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  43.58 
 
 		 641 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  38.71 
 
 		 643 aa  457  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  36.3 
 
 		 668 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  39.36 
 
 		 652 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  42.39 
 
 		 564 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 767 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  36.77 
 
 		 645 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  42.32 
 
 		 690 aa  442  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  42.64 
 
 		 569 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  42.56 
 
 		 581 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  36.21 
 
 		 667 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  43.1 
 
 		 567 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  39.24 
 
 		 650 aa  438  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  39.36 
 
 		 652 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  42.19 
 
 		 575 aa  438  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  41.47 
 
 		 653 aa  432  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  38.32 
 
 		 651 aa  435  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  43.5 
 
 		 564 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  38.01 
 
 		 619 aa  432  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  41.39 
 
 		 709 aa  431  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  35.94 
 
 		 649 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 		 645 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  38.95 
 
 		 545 aa  422  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  35.58 
 
 		 649 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  39.61 
 
 		 656 aa  422  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  39.7 
 
 		 540 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  37.63 
 
 		 650 aa  420  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  37.93 
 
 		 644 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  40.08 
 
 		 560 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  38.19 
 
 		 540 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  38.56 
 
 		 540 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  38.56 
 
 		 540 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  38.69 
 
 		 549 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  39.13 
 
 		 548 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  40.82 
 
 		 543 aa  415  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  38.87 
 
 		 545 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  39.7 
 
 		 540 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  39.33 
 
 		 545 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  40.65 
 
 		 544 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  39.81 
 
 		 543 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  35.59 
 
 		 636 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  38.75 
 
 		 548 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  39.89 
 
 		 540 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  39.89 
 
 		 540 aa  411  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  38.5 
 
 		 642 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  39.15 
 
 		 574 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  37.15 
 
 		 641 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  39.25 
 
 		 542 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  39.51 
 
 		 540 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  40.08 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  38.75 
 
 		 548 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  35.29 
 
 		 664 aa  411  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  41.48 
 
 		 536 aa  410  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  39.51 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  35.43 
 
 		 648 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  38.75 
 
 		 545 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  38.5 
 
 		 544 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  39.7 
 
 		 540 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  40.08 
 
 		 540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  35.69 
 
 		 648 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.46 
 
 		 635 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  35.12 
 
 		 624 aa  405  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  39.82 
 
 		 541 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.51 
 
 		 541 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 641 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.56 
 
 		 645 aa  401  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  38.94 
 
 		 540 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  40.41 
 
 		 536 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  39.13 
 
 		 540 aa  402  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  40.22 
 
 		 541 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  40.6 
 
 		 572 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  35.93 
 
 		 634 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  38.56 
 
 		 539 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  40.04 
 
 		 540 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  40.22 
 
 		 572 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  34.66 
 
 		 648 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.48 
 
 		 635 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.48 
 
 		 635 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.68 
 
 		 635 aa  398  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0373  ATPase  39.77 
 
 		 583 aa  398  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  37.05 
 
 		 540 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.96 
 
 		 637 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  39.16 
 
 		 546 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  39.51 
 
 		 565 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  34.8 
 
 		 637 aa  395  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0830  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.07 
 
 		 673 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  39.74 
 
 		 574 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.8 
 
 		 637 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>