More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0093 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  81.9 
 
 
540 aa  919    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
536 aa  1077    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  93.08 
 
 
541 aa  1016    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  92.52 
 
 
541 aa  1011    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  55.7 
 
 
581 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  57.46 
 
 
572 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  57.28 
 
 
572 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  53.64 
 
 
564 aa  617  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  56.72 
 
 
575 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  54.39 
 
 
575 aa  615  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  53.54 
 
 
574 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  53.64 
 
 
567 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  54.39 
 
 
564 aa  596  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  53.73 
 
 
574 aa  594  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  53.46 
 
 
569 aa  586  1e-166  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0373  ATPase  52.72 
 
 
583 aa  575  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49454  ABC(ATP-binding) family transporter  43.31 
 
 
649 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00209815  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  41.91 
 
 
879 aa  442  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  43.3 
 
 
767 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  41.73 
 
 
644 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  40.3 
 
 
659 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  37.57 
 
 
540 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  36.82 
 
 
668 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 
644 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  39.55 
 
 
662 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  39.37 
 
 
658 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 
658 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 
658 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 
659 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  36.45 
 
 
540 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  37.2 
 
 
548 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  38.81 
 
 
649 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 
644 aa  405  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  38.81 
 
 
645 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  37.01 
 
 
540 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  37.15 
 
 
540 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 
645 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  39.59 
 
 
641 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  39.18 
 
 
658 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  37.9 
 
 
672 aa  401  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  37.38 
 
 
560 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  37.2 
 
 
548 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  39.18 
 
 
640 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  37.94 
 
 
540 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  36.82 
 
 
548 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 
658 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  38.09 
 
 
690 aa  399  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  40.41 
 
 
632 aa  401  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  38.25 
 
 
649 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  37.15 
 
 
540 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  37.52 
 
 
540 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  37.38 
 
 
545 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  37.38 
 
 
540 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  36.64 
 
 
540 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  40.37 
 
 
638 aa  392  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  37.69 
 
 
641 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.38 
 
 
541 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  39.92 
 
 
634 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  40.89 
 
 
636 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 
540 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  40.67 
 
 
641 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  37.22 
 
 
545 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.5 
 
 
709 aa  389  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  36.45 
 
 
565 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  38.72 
 
 
666 aa  388  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  36.07 
 
 
540 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  36.82 
 
 
540 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  36.07 
 
 
540 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  38.99 
 
 
646 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  37.01 
 
 
540 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  38.55 
 
 
630 aa  382  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  38.99 
 
 
638 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 
643 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  41.74 
 
 
643 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  38.18 
 
 
643 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  37.79 
 
 
643 aa  375  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  39.63 
 
 
642 aa  375  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  35.26 
 
 
539 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  38.18 
 
 
637 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  35.33 
 
 
540 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  37.52 
 
 
619 aa  372  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  35.33 
 
 
540 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  39.63 
 
 
642 aa  375  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  39.26 
 
 
639 aa  372  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 
663 aa  372  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  35.12 
 
 
543 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  35.3 
 
 
544 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  37.38 
 
 
639 aa  369  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  36.23 
 
 
545 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  42.62 
 
 
630 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  39.22 
 
 
535 aa  367  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  38.88 
 
 
644 aa  368  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  38.65 
 
 
656 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 
663 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  35.06 
 
 
549 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  37.92 
 
 
667 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  37.36 
 
 
645 aa  366  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  40.18 
 
 
640 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  35.12 
 
 
542 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  36.5 
 
 
685 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>