More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50537 on replicon NC_011699
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  100 
 
 
879 aa  1803    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  50.82 
 
 
564 aa  548  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  50.64 
 
 
581 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  51.57 
 
 
567 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  49.91 
 
 
575 aa  536  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  49.28 
 
 
564 aa  527  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  49.45 
 
 
569 aa  511  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  48.53 
 
 
572 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  48.35 
 
 
572 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49454  ABC(ATP-binding) family transporter  43.42 
 
 
649 aa  484  1e-135  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00209815  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  47.16 
 
 
574 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  46.25 
 
 
574 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  46.61 
 
 
575 aa  466  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0373  ATPase  46.93 
 
 
583 aa  465  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  41.76 
 
 
541 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  41.1 
 
 
541 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  41.91 
 
 
536 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  40.4 
 
 
540 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  40.29 
 
 
767 aa  416  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  40.07 
 
 
649 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  39.64 
 
 
645 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  39.02 
 
 
645 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  38.56 
 
 
641 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  38.31 
 
 
638 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  38.95 
 
 
690 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  37.91 
 
 
668 aa  375  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  37.5 
 
 
649 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  37.18 
 
 
630 aa  372  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  37.29 
 
 
545 aa  365  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  37.85 
 
 
672 aa  363  7.0000000000000005e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  36.46 
 
 
545 aa  363  8e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  35.96 
 
 
540 aa  363  9e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  36.28 
 
 
543 aa  362  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  36.15 
 
 
540 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  35.95 
 
 
637 aa  358  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  35.96 
 
 
540 aa  358  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  35.96 
 
 
540 aa  358  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  36.38 
 
 
544 aa  357  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  38.41 
 
 
648 aa  357  5e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 
632 aa  356  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 
643 aa  355  2.9999999999999997e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  37.93 
 
 
648 aa  355  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  35.66 
 
 
542 aa  353  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  35.58 
 
 
540 aa  353  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  36.31 
 
 
543 aa  351  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  37.83 
 
 
667 aa  351  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  35.83 
 
 
544 aa  350  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  36.2 
 
 
540 aa  350  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  34.68 
 
 
540 aa  350  7e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.91 
 
 
541 aa  350  8e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  35.47 
 
 
549 aa  350  9e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  36.07 
 
 
664 aa  349  1e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  35.9 
 
 
545 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  36.1 
 
 
540 aa  348  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  35.28 
 
 
540 aa  348  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  37.16 
 
 
641 aa  348  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  37.04 
 
 
539 aa  347  6e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  35.18 
 
 
560 aa  347  6e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.23 
 
 
548 aa  347  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  35.05 
 
 
548 aa  346  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  34.86 
 
 
548 aa  345  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  34.97 
 
 
540 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  34.79 
 
 
540 aa  344  4e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  35.87 
 
 
659 aa  344  5e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  35.4 
 
 
540 aa  343  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  35.78 
 
 
540 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  35.45 
 
 
656 aa  341  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  33.21 
 
 
545 aa  341  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  35.23 
 
 
540 aa  341  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  35.86 
 
 
643 aa  341  4e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  35.04 
 
 
634 aa  340  5.9999999999999996e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  35.82 
 
 
644 aa  340  9e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  34.07 
 
 
546 aa  339  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  35.91 
 
 
667 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.59 
 
 
709 aa  339  1.9999999999999998e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  36.01 
 
 
540 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  35.25 
 
 
619 aa  338  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  36.43 
 
 
659 aa  338  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  35.47 
 
 
540 aa  337  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  34.92 
 
 
540 aa  337  7e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  37.11 
 
 
659 aa  336  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  36.1 
 
 
658 aa  336  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  34.94 
 
 
646 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  37.06 
 
 
638 aa  336  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 
658 aa  335  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 
643 aa  335  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  35.91 
 
 
658 aa  335  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 
658 aa  334  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  35.91 
 
 
640 aa  335  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 
644 aa  334  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  35.56 
 
 
649 aa  334  4e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  36 
 
 
650 aa  334  5e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  36.62 
 
 
640 aa  334  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  35.62 
 
 
643 aa  334  5e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  38.58 
 
 
630 aa  333  6e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  35.11 
 
 
636 aa  334  6e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 
662 aa  333  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  35.33 
 
 
658 aa  332  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.94 
 
 
645 aa  332  2e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  34.23 
 
 
565 aa  332  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>