More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0351 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 636 aa  644    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  52.11 
 
 		 644 aa  655    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  100 
 
 		 645 aa  1324    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  51.64 
 
 		 635 aa  675    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  51.17 
 
 		 639 aa  664    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  48.83 
 
 		 659 aa  629  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  50.08 
 
 		 641 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 662 aa  626  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  48.67 
 
 		 658 aa  626  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  48.83 
 
 		 658 aa  626  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  48.83 
 
 		 640 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  48.67 
 
 		 658 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 		 644 aa  627  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  48.14 
 
 		 644 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  48.67 
 
 		 658 aa  625  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  50.16 
 
 		 659 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  47.34 
 
 		 658 aa  611  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  48.28 
 
 		 636 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  45.06 
 
 		 643 aa  581  1e-164  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  44.36 
 
 		 644 aa  555  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  43.97 
 
 		 638 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  44.2 
 
 		 642 aa  554  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  44.2 
 
 		 642 aa  554  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  41.81 
 
 		 634 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  41.71 
 
 		 638 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  39.15 
 
 		 630 aa  478  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  37.97 
 
 		 666 aa  472  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  40.94 
 
 		 634 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  37.58 
 
 		 632 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  38.35 
 
 		 641 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  38.36 
 
 		 643 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  38.39 
 
 		 620 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  36.38 
 
 		 657 aa  425  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  37.58 
 
 		 643 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  37.5 
 
 		 667 aa  425  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  34.63 
 
 		 639 aa  419  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  35.96 
 
 		 649 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  34.84 
 
 		 627 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  36.92 
 
 		 767 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  35.73 
 
 		 649 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  37.34 
 
 		 640 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  38.3 
 
 		 641 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  40.52 
 
 		 542 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  37.16 
 
 		 659 aa  402  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  39.29 
 
 		 543 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  39.55 
 
 		 540 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  35.29 
 
 		 649 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  35.03 
 
 		 668 aa  402  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  35.43 
 
 		 672 aa  400  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  40.15 
 
 		 540 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 		 545 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  37.62 
 
 		 540 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  39.29 
 
 		 549 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  38.73 
 
 		 544 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  35.03 
 
 		 690 aa  398  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  34.82 
 
 		 641 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  37.24 
 
 		 540 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  38.72 
 
 		 564 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  37.43 
 
 		 540 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 		 632 aa  392  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  38.18 
 
 		 543 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  34.79 
 
 		 645 aa  392  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.92 
 
 		 645 aa  389  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  36.15 
 
 		 659 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  38.69 
 
 		 581 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  36.08 
 
 		 638 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 		 663 aa  385  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  35.66 
 
 		 645 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  34.24 
 
 		 663 aa  384  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  34.75 
 
 		 641 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  36.28 
 
 		 540 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  37.2 
 
 		 540 aa  381  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  37.02 
 
 		 540 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  34.15 
 
 		 656 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  35.27 
 
 		 685 aa  381  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  37.75 
 
 		 540 aa  382  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  37.11 
 
 		 540 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  32.35 
 
 		 646 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  37.11 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  36.28 
 
 		 540 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  35.42 
 
 		 636 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  37.36 
 
 		 535 aa  375  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  38.73 
 
 		 560 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  36.65 
 
 		 540 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  35.99 
 
 		 540 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  37.11 
 
 		 540 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  35.81 
 
 		 548 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  37.02 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  37.11 
 
 		 539 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  37.52 
 
 		 569 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  37.9 
 
 		 540 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  36.92 
 
 		 540 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  35.81 
 
 		 548 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  34.08 
 
 		 648 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  39.17 
 
 		 567 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5082  ABC transporter, ATP-binding protein  36.38 
 
 		 626 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0119916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0205  ABC transporter related  38.5 
 
 		 628 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  37.36 
 
 		 536 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.44 
 
 		 548 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  38.25 
 
 		 564 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>