More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0949 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  84.44 
 
 		 540 aa  932    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  84.07 
 
 		 540 aa  930    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  74.54 
 
 		 548 aa  851    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  84.44 
 
 		 540 aa  940    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  83.52 
 
 		 540 aa  940    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  82.59 
 
 		 565 aa  911    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  80.93 
 
 		 540 aa  898    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  80.15 
 
 		 540 aa  867    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  74.63 
 
 		 548 aa  858    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  97.41 
 
 		 540 aa  1059    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  88.15 
 
 		 540 aa  976    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  83.33 
 
 		 540 aa  927    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  100 
 
 		 540 aa  1107    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  82.59 
 
 		 540 aa  913    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  83.15 
 
 		 540 aa  946    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  61.83 
 
 		 545 aa  698    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  81.48 
 
 		 541 aa  909    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  73.79 
 
 		 545 aa  847    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  81.6 
 
 		 540 aa  894    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  83.52 
 
 		 540 aa  940    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  82.96 
 
 		 540 aa  938    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  93.51 
 
 		 539 aa  1017    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  83.52 
 
 		 540 aa  926    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  74.54 
 
 		 548 aa  853    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  81.04 
 
 		 560 aa  908    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  51.76 
 
 		 543 aa  578  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  53.45 
 
 		 545 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  52.76 
 
 		 544 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  52.13 
 
 		 540 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  51.76 
 
 		 540 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  50.74 
 
 		 549 aa  561  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  51.77 
 
 		 543 aa  560  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  52.85 
 
 		 542 aa  556  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  44.67 
 
 		 668 aa  475  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  42.4 
 
 		 690 aa  451  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  41.48 
 
 		 663 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 663 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  43.36 
 
 		 709 aa  443  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  40.34 
 
 		 685 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  42 
 
 		 672 aa  432  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  41.59 
 
 		 638 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 632 aa  425  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  39.96 
 
 		 536 aa  409  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  40.07 
 
 		 581 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  39.41 
 
 		 564 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  39.7 
 
 		 575 aa  406  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  42.7 
 
 		 645 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  42.48 
 
 		 569 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  41.25 
 
 		 645 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  41.51 
 
 		 641 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  40.11 
 
 		 656 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  38.84 
 
 		 646 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  40.22 
 
 		 649 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  41.57 
 
 		 767 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  38.85 
 
 		 644 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  40.71 
 
 		 564 aa  395  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  38.1 
 
 		 637 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  40.3 
 
 		 649 aa  395  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  40.67 
 
 		 567 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  35.63 
 
 		 535 aa  389  1e-107  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  35.78 
 
 		 643 aa  389  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  40.6 
 
 		 667 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  35.07 
 
 		 541 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  39.74 
 
 		 619 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  40.49 
 
 		 641 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  35.07 
 
 		 541 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  37.11 
 
 		 645 aa  386  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.66 
 
 		 645 aa  383  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 688 aa  385  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  36.87 
 
 		 664 aa  385  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  39.66 
 
 		 667 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  41.36 
 
 		 574 aa  385  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  35.33 
 
 		 536 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  36.47 
 
 		 643 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  37.78 
 
 		 636 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 648 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  38.06 
 
 		 544 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  36.12 
 
 		 630 aa  378  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  35.82 
 
 		 540 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  39.37 
 
 		 641 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0830  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  41.86 
 
 		 673 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  37.52 
 
 		 635 aa  375  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  36.65 
 
 		 637 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  36.65 
 
 		 637 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 637 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 637 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  39.07 
 
 		 574 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 637 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  36.65 
 
 		 637 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  40.22 
 
 		 648 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 637 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 637 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 637 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  37.52 
 
 		 572 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  37.48 
 
 		 651 aa  373  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0876  ABC transporter-related protein  41.86 
 
 		 673 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  37.52 
 
 		 572 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  36.75 
 
 		 650 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  36.13 
 
 		 666 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.09 
 
 		 637 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>