More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2545 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  83.39 
 
 		 645 aa  1069    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  74.88 
 
 		 645 aa  954    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  57.27 
 
 		 642 aa  640    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 641 aa  1306    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  67.7 
 
 		 649 aa  880    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  72.07 
 
 		 648 aa  915    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  71.76 
 
 		 648 aa  912    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  67.54 
 
 		 649 aa  897    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  52.72 
 
 		 641 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  43.45 
 
 		 690 aa  521  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  42.71 
 
 		 668 aa  519  1e-146  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  42.43 
 
 		 663 aa  507  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  42.75 
 
 		 663 aa  507  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  43.84 
 
 		 672 aa  508  9.999999999999999e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  42.43 
 
 		 685 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 767 aa  496  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  41.43 
 
 		 630 aa  479  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  40.53 
 
 		 709 aa  474  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  46.1 
 
 		 549 aa  472  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  37.81 
 
 		 643 aa  457  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.75 
 
 		 645 aa  453  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  45.3 
 
 		 544 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  44.8 
 
 		 543 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  44.55 
 
 		 664 aa  450  1e-125  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  44.24 
 
 		 540 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  45.17 
 
 		 542 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 		 545 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1403  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 667 aa  449  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  43.9 
 
 		 581 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  43.87 
 
 		 540 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  39.36 
 
 		 650 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  40.15 
 
 		 652 aa  444  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  39.69 
 
 		 644 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  38.86 
 
 		 656 aa  444  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  38.15 
 
 		 636 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  44.3 
 
 		 543 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  44.38 
 
 		 575 aa  441  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 658 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  39.11 
 
 		 650 aa  436  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 		 659 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  40.44 
 
 		 641 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  37.02 
 
 		 646 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  39.67 
 
 		 652 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  38.41 
 
 		 658 aa  435  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  38.41 
 
 		 658 aa  435  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  38.41 
 
 		 658 aa  435  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  38.41 
 
 		 640 aa  435  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  43.76 
 
 		 545 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 662 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 644 aa  432  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  42.62 
 
 		 564 aa  432  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  44.38 
 
 		 567 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  38.99 
 
 		 635 aa  431  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  38.53 
 
 		 659 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  43.66 
 
 		 653 aa  428  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 		 644 aa  428  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  37.82 
 
 		 638 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  43.66 
 
 		 564 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  38.1 
 
 		 658 aa  425  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  38.93 
 
 		 656 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  42.03 
 
 		 637 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  37.8 
 
 		 651 aa  421  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 632 aa  419  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  39.89 
 
 		 544 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 546 aa  415  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  39.47 
 
 		 688 aa  412  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  37.03 
 
 		 639 aa  410  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  40.44 
 
 		 545 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  38.24 
 
 		 667 aa  412  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  38.8 
 
 		 619 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  38.99 
 
 		 540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  41.79 
 
 		 540 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  42.86 
 
 		 536 aa  408  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  41.76 
 
 		 569 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  40.19 
 
 		 535 aa  405  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 636 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  38.32 
 
 		 541 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  35.36 
 
 		 666 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  35.09 
 
 		 667 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  41.61 
 
 		 540 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  41.61 
 
 		 540 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  42.4 
 
 		 548 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  40.1 
 
 		 574 aa  396  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  41.76 
 
 		 548 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.51 
 
 		 541 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  42.4 
 
 		 548 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  37.38 
 
 		 541 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49454  ABC(ATP-binding) family transporter  37.87 
 
 		 649 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00209815  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  37.69 
 
 		 536 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  36.64 
 
 		 638 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  41.06 
 
 		 540 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  39.37 
 
 		 572 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  38.56 
 
 		 879 aa  391  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  34.57 
 
 		 634 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  34.58 
 
 		 645 aa  391  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  41.06 
 
 		 540 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0405  ABC transporter related protein  38.64 
 
 		 658 aa  389  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224406  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  40.95 
 
 		 540 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  37.75 
 
 		 632 aa  389  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  39.55 
 
 		 572 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>