More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2970 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  81.85 
 
 		 540 aa  910    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  82.59 
 
 		 540 aa  918    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  82.78 
 
 		 541 aa  918    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  81.08 
 
 		 560 aa  902    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  83.52 
 
 		 540 aa  926    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  72.86 
 
 		 548 aa  829    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  82.41 
 
 		 540 aa  918    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  82.16 
 
 		 539 aa  907    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  82.41 
 
 		 565 aa  911    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  81.04 
 
 		 540 aa  878    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  72.96 
 
 		 548 aa  834    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  83.52 
 
 		 540 aa  922    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  85 
 
 		 540 aa  933    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  82.22 
 
 		 540 aa  936    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  81.08 
 
 		 540 aa  883    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  83.33 
 
 		 540 aa  932    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  82.59 
 
 		 540 aa  912    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  72.86 
 
 		 548 aa  827    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  87.59 
 
 		 540 aa  957    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  100 
 
 		 540 aa  1105    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  80.56 
 
 		 540 aa  889    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  61.83 
 
 		 545 aa  701    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  82.59 
 
 		 540 aa  928    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  83.52 
 
 		 540 aa  935    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  72.36 
 
 		 545 aa  821    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  52.94 
 
 		 544 aa  585  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  51.77 
 
 		 543 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  51.11 
 
 		 549 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  51.95 
 
 		 545 aa  568  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  52.49 
 
 		 542 aa  568  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  51.58 
 
 		 540 aa  567  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  51.96 
 
 		 540 aa  567  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  50.74 
 
 		 543 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  44.19 
 
 		 668 aa  477  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  43.26 
 
 		 690 aa  457  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 663 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 663 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  40.53 
 
 		 685 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  43.53 
 
 		 709 aa  445  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  41.6 
 
 		 672 aa  436  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  41.1 
 
 		 638 aa  428  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  42.15 
 
 		 645 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  40.56 
 
 		 575 aa  423  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 632 aa  422  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  40.26 
 
 		 564 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  41.79 
 
 		 649 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 645 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  42.04 
 
 		 564 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  41.09 
 
 		 767 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  40.22 
 
 		 649 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  41.59 
 
 		 641 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  40.07 
 
 		 536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  38.01 
 
 		 643 aa  402  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  39.7 
 
 		 644 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  39.74 
 
 		 581 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  39.62 
 
 		 637 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  40.26 
 
 		 656 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  36.94 
 
 		 541 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  39.51 
 
 		 646 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  41.32 
 
 		 569 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  36.75 
 
 		 541 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  40.82 
 
 		 567 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  41.06 
 
 		 641 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 		 536 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  37.57 
 
 		 540 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  36.33 
 
 		 643 aa  392  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  41.08 
 
 		 667 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  38.27 
 
 		 688 aa  395  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  42.14 
 
 		 574 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  37.99 
 
 		 636 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  41.14 
 
 		 648 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.42 
 
 		 645 aa  386  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  37.02 
 
 		 645 aa  389  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  38.14 
 
 		 651 aa  386  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  40.77 
 
 		 648 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  35.78 
 
 		 535 aa  382  1e-105  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  35.67 
 
 		 634 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  39.02 
 
 		 667 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  36.5 
 
 		 630 aa  379  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  38.26 
 
 		 619 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  36.45 
 
 		 666 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  35.73 
 
 		 639 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  37.11 
 
 		 650 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  39.37 
 
 		 641 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  37.09 
 
 		 544 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  36.72 
 
 		 664 aa  377  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.69 
 
 		 637 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0405  ABC transporter related protein  41.24 
 
 		 658 aa  375  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224406  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  37.89 
 
 		 653 aa  373  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  36.5 
 
 		 659 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  39.33 
 
 		 574 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0878  ABC transporter related  41.67 
 
 		 694 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.0940441 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  37.9 
 
 		 635 aa  373  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  40.19 
 
 		 659 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  37.48 
 
 		 545 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 		 635 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  36.5 
 
 		 658 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 		 635 aa  372  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  36.88 
 
 		 652 aa  370  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0830  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  42.05 
 
 		 673 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>