More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4285 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  71.1 
 
 
646 aa  956    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  56.27 
 
 
638 aa  752    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  100 
 
 
656 aa  1349    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  60.7 
 
 
632 aa  824    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  50.53 
 
 
667 aa  636    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  61.35 
 
 
535 aa  684    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  40.18 
 
 
630 aa  472  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  40.6 
 
 
652 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 
663 aa  463  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 
663 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  40.69 
 
 
652 aa  465  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  38.12 
 
 
667 aa  463  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  39.79 
 
 
653 aa  457  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  39.23 
 
 
651 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  37.52 
 
 
668 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  39.97 
 
 
656 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  36.87 
 
 
643 aa  439  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  37.52 
 
 
685 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  39.41 
 
 
767 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  37.96 
 
 
650 aa  439  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  38 
 
 
650 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  39.57 
 
 
641 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  37.95 
 
 
672 aa  431  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  41.03 
 
 
637 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
645 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.17 
 
 
645 aa  427  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  37.88 
 
 
690 aa  427  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  40.3 
 
 
564 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  40.45 
 
 
540 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  41.4 
 
 
575 aa  428  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  40.3 
 
 
540 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  37.25 
 
 
645 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  38.48 
 
 
641 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.8 
 
 
709 aa  421  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  39.7 
 
 
545 aa  421  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.56 
 
 
635 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  40.83 
 
 
545 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  35.39 
 
 
636 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  40.73 
 
 
548 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  41.59 
 
 
567 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  39.12 
 
 
644 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  40.11 
 
 
548 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  40.49 
 
 
540 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.56 
 
 
635 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  40.73 
 
 
548 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  40.11 
 
 
581 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  40.26 
 
 
542 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.56 
 
 
635 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  39.3 
 
 
641 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  39.66 
 
 
549 aa  415  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.79 
 
 
635 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  39.11 
 
 
544 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  41.78 
 
 
569 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.18 
 
 
635 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  38.94 
 
 
540 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  37.23 
 
 
659 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  37.03 
 
 
619 aa  413  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  37.87 
 
 
659 aa  412  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  35.57 
 
 
637 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  35.57 
 
 
637 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  37.08 
 
 
644 aa  412  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 
637 aa  411  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.12 
 
 
637 aa  411  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.57 
 
 
637 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.13 
 
 
637 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.57 
 
 
637 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  40.11 
 
 
540 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.57 
 
 
637 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  35.57 
 
 
637 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  40.3 
 
 
564 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  38.81 
 
 
636 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  39.85 
 
 
540 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.23 
 
 
635 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  39.85 
 
 
543 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  35.78 
 
 
649 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  39.74 
 
 
540 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  36.32 
 
 
658 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
658 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  36.47 
 
 
658 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  38.19 
 
 
540 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.14 
 
 
637 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 
644 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  37.87 
 
 
659 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  40.59 
 
 
642 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  36.32 
 
 
640 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  39.89 
 
 
540 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  39.89 
 
 
540 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
658 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  40.26 
 
 
540 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  40.99 
 
 
536 aa  408  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  39.51 
 
 
560 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  38.19 
 
 
540 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 
545 aa  405  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 
662 aa  405  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.36 
 
 
541 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  35.79 
 
 
649 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  39.55 
 
 
540 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  39.47 
 
 
664 aa  403  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.84 
 
 
637 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 
635 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>