More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0378 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  66.3 
 
 
637 aa  874    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  100 
 
 
630 aa  1283    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  66.14 
 
 
643 aa  883    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.85 
 
 
645 aa  572  1.0000000000000001e-162  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  50.73 
 
 
546 aa  567  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  49.26 
 
 
544 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  50.19 
 
 
545 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  43.31 
 
 
638 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 
632 aa  483  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  39.85 
 
 
646 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  40.27 
 
 
649 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  40.67 
 
 
649 aa  463  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  39.1 
 
 
645 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  40.85 
 
 
651 aa  461  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  40.9 
 
 
641 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  45.52 
 
 
653 aa  457  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  41.54 
 
 
656 aa  457  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  44.07 
 
 
535 aa  456  1e-127  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  39.63 
 
 
645 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  40.18 
 
 
656 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  40.91 
 
 
652 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  40.48 
 
 
650 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  41.95 
 
 
664 aa  444  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  42.86 
 
 
668 aa  441  9.999999999999999e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  40 
 
 
652 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  41.6 
 
 
564 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
767 aa  436  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  40.09 
 
 
650 aa  435  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  38.96 
 
 
672 aa  426  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  39.41 
 
 
648 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  41.76 
 
 
575 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  38.34 
 
 
648 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  42.21 
 
 
690 aa  424  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  41.79 
 
 
564 aa  423  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  35.76 
 
 
667 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  37.85 
 
 
641 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
663 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  38.5 
 
 
641 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  37.62 
 
 
685 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 
663 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  39.89 
 
 
581 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  37.09 
 
 
659 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  40.82 
 
 
549 aa  411  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  41.57 
 
 
569 aa  412  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  40.88 
 
 
543 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  40.98 
 
 
567 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  37.89 
 
 
644 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  44.59 
 
 
642 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  42.08 
 
 
709 aa  408  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  36.38 
 
 
658 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  36.38 
 
 
658 aa  405  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  36.53 
 
 
658 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  37.12 
 
 
644 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  36.38 
 
 
640 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  36.38 
 
 
658 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  39.36 
 
 
545 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 
662 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  40.38 
 
 
667 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  40.41 
 
 
544 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 
644 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  39.93 
 
 
545 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  36.28 
 
 
666 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  36.49 
 
 
659 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  35.91 
 
 
658 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  40.3 
 
 
542 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  35.2 
 
 
639 aa  390  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  38.64 
 
 
545 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  39.21 
 
 
574 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  40.65 
 
 
643 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  39.82 
 
 
543 aa  392  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  37.16 
 
 
635 aa  390  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  38.82 
 
 
540 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  38.48 
 
 
540 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  35.55 
 
 
634 aa  389  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  40.11 
 
 
643 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  38.82 
 
 
540 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  35.31 
 
 
642 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  37.52 
 
 
619 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  35.31 
 
 
642 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  40.22 
 
 
574 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  34.72 
 
 
659 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  36.5 
 
 
540 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  36.09 
 
 
644 aa  379  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  34.37 
 
 
632 aa  382  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  40.97 
 
 
572 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  38.55 
 
 
536 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  38.14 
 
 
548 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  35.78 
 
 
688 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  38.13 
 
 
541 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  36.94 
 
 
639 aa  381  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  38.13 
 
 
541 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  38.33 
 
 
548 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1403  ABC transporter, ATP-binding protein  34.94 
 
 
667 aa  378  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  40.97 
 
 
572 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  37.76 
 
 
548 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  37.26 
 
 
540 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  37.12 
 
 
540 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  37.89 
 
 
540 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  37.89 
 
 
540 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  37.48 
 
 
575 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>