More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0716 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  82.22 
 
 		 540 aa  938    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  82.96 
 
 		 540 aa  923    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  82.16 
 
 		 540 aa  899    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  82.04 
 
 		 540 aa  936    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  90.19 
 
 		 565 aa  1000    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  71.19 
 
 		 548 aa  822    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  81.85 
 
 		 540 aa  934    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  86.67 
 
 		 540 aa  961    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  81.11 
 
 		 540 aa  904    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  71.38 
 
 		 545 aa  816    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  82.56 
 
 		 540 aa  897    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  82.22 
 
 		 540 aa  921    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  72.09 
 
 		 548 aa  832    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  81.85 
 
 		 540 aa  911    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  83.7 
 
 		 540 aa  926    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  81.48 
 
 		 540 aa  909    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  82.78 
 
 		 540 aa  918    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  60.92 
 
 		 545 aa  693    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  87.04 
 
 		 540 aa  986    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  90.52 
 
 		 560 aa  1004    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 541 aa  1112    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  71.19 
 
 		 548 aa  819    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  81.45 
 
 		 539 aa  906    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  82.96 
 
 		 540 aa  920    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  83.7 
 
 		 540 aa  937    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  52.76 
 
 		 544 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  51.58 
 
 		 543 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  51.76 
 
 		 545 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  50.56 
 
 		 549 aa  561  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  51.58 
 
 		 543 aa  552  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  51.02 
 
 		 540 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  51.02 
 
 		 540 aa  548  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  51.38 
 
 		 542 aa  547  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  43.07 
 
 		 668 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 663 aa  456  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  41.97 
 
 		 663 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  43.69 
 
 		 709 aa  451  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  41.84 
 
 		 690 aa  451  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  41.59 
 
 		 685 aa  450  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  42.21 
 
 		 672 aa  432  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  41.05 
 
 		 638 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  41.28 
 
 		 536 aa  416  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  40.11 
 
 		 564 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 		 632 aa  417  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  42.1 
 
 		 645 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  39.22 
 
 		 575 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  41.57 
 
 		 767 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  37.5 
 
 		 541 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  37.13 
 
 		 541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  38.64 
 
 		 646 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  38.95 
 
 		 581 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 		 536 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  40.22 
 
 		 649 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  39.93 
 
 		 645 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  40.07 
 
 		 644 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  41.51 
 
 		 641 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  40.93 
 
 		 564 aa  401  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  40.3 
 
 		 649 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  39.36 
 
 		 656 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  41.01 
 
 		 569 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  41.01 
 
 		 567 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  37.29 
 
 		 643 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  38.66 
 
 		 637 aa  399  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  37.76 
 
 		 540 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  42.1 
 
 		 574 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  40.75 
 
 		 641 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  41.31 
 
 		 667 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  38.13 
 
 		 688 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  38.45 
 
 		 572 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  39.37 
 
 		 619 aa  386  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  38.45 
 
 		 572 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  35.78 
 
 		 535 aa  387  1e-106  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.23 
 
 		 645 aa  383  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  40.26 
 
 		 574 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.14 
 
 		 635 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.52 
 
 		 637 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  36.5 
 
 		 643 aa  385  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.14 
 
 		 635 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.14 
 
 		 635 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  38.33 
 
 		 637 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  38.33 
 
 		 637 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 		 637 aa  381  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  38.33 
 
 		 637 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 		 637 aa  382  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  39.37 
 
 		 641 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.14 
 
 		 635 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.14 
 
 		 635 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.45 
 
 		 637 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.95 
 
 		 635 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.95 
 
 		 635 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 		 637 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 		 637 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 		 637 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  39.48 
 
 		 648 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  36.45 
 
 		 630 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  36.16 
 
 		 639 aa  376  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  38.52 
 
 		 667 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  36.59 
 
 		 634 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  36.87 
 
 		 636 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  38.68 
 
 		 635 aa  377  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>