More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0900 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  100 
 
 		 666 aa  1361    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  41.83 
 
 		 634 aa  547  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  41.19 
 
 		 639 aa  525  1e-148  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  43.46 
 
 		 643 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  41.73 
 
 		 658 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  41.58 
 
 		 659 aa  521  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 		 658 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 		 658 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 		 658 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 		 640 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 		 658 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  40.9 
 
 		 662 aa  514  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  43.31 
 
 		 643 aa  515  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  40.9 
 
 		 644 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  43.61 
 
 		 638 aa  511  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  40.9 
 
 		 644 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 641 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  41.04 
 
 		 659 aa  504  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  39.82 
 
 		 636 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  39.97 
 
 		 635 aa  491  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  39.4 
 
 		 644 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  37.97 
 
 		 645 aa  483  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  38.89 
 
 		 639 aa  476  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  40.63 
 
 		 630 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  39.97 
 
 		 638 aa  475  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  44.49 
 
 		 640 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 636 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 767 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  37.25 
 
 		 643 aa  456  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  40.49 
 
 		 634 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  38.3 
 
 		 642 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  38.3 
 
 		 642 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  36.76 
 
 		 668 aa  436  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  35.51 
 
 		 649 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  35.72 
 
 		 690 aa  428  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 644 aa  422  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  38.65 
 
 		 564 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  37.22 
 
 		 620 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  38.84 
 
 		 575 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 663 aa  414  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  36.03 
 
 		 685 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  37.83 
 
 		 581 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  35.09 
 
 		 672 aa  411  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 		 663 aa  412  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  35.96 
 
 		 649 aa  409  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  34.43 
 
 		 649 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  36.96 
 
 		 641 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  36 
 
 		 630 aa  403  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.32 
 
 		 645 aa  399  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  38.84 
 
 		 567 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  33.88 
 
 		 645 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  35.21 
 
 		 648 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  35.36 
 
 		 638 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  34.03 
 
 		 646 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  39.66 
 
 		 641 aa  395  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  38.06 
 
 		 564 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  39.33 
 
 		 549 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  35.42 
 
 		 632 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  35.06 
 
 		 641 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 645 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  35.87 
 
 		 657 aa  389  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  34.97 
 
 		 648 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  38.72 
 
 		 536 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  32.75 
 
 		 667 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  34.11 
 
 		 709 aa  385  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 545 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  35.13 
 
 		 643 aa  387  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  38.09 
 
 		 540 aa  389  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  38.62 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  38.27 
 
 		 569 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  34.53 
 
 		 627 aa  384  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 632 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  38.33 
 
 		 540 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  38.62 
 
 		 541 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  38.33 
 
 		 540 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  37.87 
 
 		 542 aa  382  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  33.84 
 
 		 636 aa  379  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  37.96 
 
 		 543 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  32.83 
 
 		 667 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  37.03 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  36.17 
 
 		 540 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  37.03 
 
 		 540 aa  375  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  36.47 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 		 545 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  35.08 
 
 		 540 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  36.83 
 
 		 544 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  37.71 
 
 		 543 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  36.52 
 
 		 540 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  37.66 
 
 		 641 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  37.69 
 
 		 637 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  37.12 
 
 		 545 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  36.86 
 
 		 540 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  37.22 
 
 		 574 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  37.64 
 
 		 540 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  37.31 
 
 		 540 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  37.11 
 
 		 560 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  32.79 
 
 		 656 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.07 
 
 		 541 aa  366  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  37.11 
 
 		 535 aa  364  2e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  37.84 
 
 		 659 aa  364  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>