More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2696 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  57.51 
 
 
632 aa  697    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  51.9 
 
 
649 aa  656    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  100 
 
 
659 aa  1327    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  81.54 
 
 
659 aa  1011    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  36.84 
 
 
636 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  35.58 
 
 
645 aa  432  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  41.24 
 
 
620 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  38.92 
 
 
644 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 
636 aa  419  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  39.19 
 
 
641 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  35.2 
 
 
639 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  37.54 
 
 
634 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  36.45 
 
 
659 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  35.34 
 
 
658 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  35.38 
 
 
640 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  34.89 
 
 
644 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  35.15 
 
 
662 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 
644 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 
658 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 
658 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 
658 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  34.53 
 
 
659 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  34.23 
 
 
634 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  34.9 
 
 
635 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  33.98 
 
 
658 aa  399  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  35.56 
 
 
638 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  33.43 
 
 
643 aa  395  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  35.57 
 
 
640 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  35.53 
 
 
638 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  37.22 
 
 
636 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  35.91 
 
 
649 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  32.88 
 
 
644 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  34.34 
 
 
642 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  34.34 
 
 
642 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  35.61 
 
 
638 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  39.08 
 
 
767 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  36.1 
 
 
666 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  33.33 
 
 
630 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  36.16 
 
 
643 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  40.22 
 
 
575 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  34.21 
 
 
667 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  39.38 
 
 
544 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  36.95 
 
 
668 aa  374  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 
643 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  34.33 
 
 
649 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  34.36 
 
 
641 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 
645 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  31.94 
 
 
646 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  35.3 
 
 
651 aa  371  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  40 
 
 
672 aa  372  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  39.02 
 
 
543 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  40.14 
 
 
542 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  38.76 
 
 
564 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  33.23 
 
 
639 aa  369  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  34.13 
 
 
656 aa  364  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  33.53 
 
 
632 aa  365  2e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  34.74 
 
 
645 aa  365  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  38.29 
 
 
540 aa  364  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  37.93 
 
 
540 aa  364  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  35.97 
 
 
641 aa  362  9e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  34.44 
 
 
650 aa  362  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  37.7 
 
 
543 aa  362  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  39.64 
 
 
657 aa  362  1e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 
545 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  32.81 
 
 
630 aa  361  3e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  38.21 
 
 
581 aa  360  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  33.74 
 
 
650 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  39.85 
 
 
569 aa  357  2.9999999999999997e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  34.68 
 
 
663 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  37.55 
 
 
690 aa  357  5e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  34.23 
 
 
663 aa  355  2e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  37 
 
 
653 aa  353  5e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  34.59 
 
 
685 aa  353  7e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  34.54 
 
 
641 aa  353  8e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  35.04 
 
 
652 aa  352  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  39.78 
 
 
567 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4548  ABC transporter related protein  35.28 
 
 
644 aa  350  6e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  30.48 
 
 
627 aa  350  7e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  35.98 
 
 
549 aa  349  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  34.08 
 
 
648 aa  349  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  33.53 
 
 
648 aa  349  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  36.14 
 
 
652 aa  348  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2379  ABC transporter related  37.14 
 
 
660 aa  346  6e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  35.33 
 
 
535 aa  346  7e-94  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  35.04 
 
 
541 aa  346  8.999999999999999e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  38.21 
 
 
564 aa  345  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.23 
 
 
645 aa  344  2.9999999999999997e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0204  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 
626 aa  344  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  37.29 
 
 
879 aa  342  1e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  36.98 
 
 
540 aa  342  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  34.49 
 
 
541 aa  342  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  34.36 
 
 
540 aa  342  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  36.07 
 
 
540 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  36.62 
 
 
540 aa  341  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0217  ABC transporter ATP-binding protein  38.21 
 
 
626 aa  340  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0228  ABC transporter ATP-binding protein  38.21 
 
 
626 aa  340  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  36.73 
 
 
540 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  32.69 
 
 
656 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0262  ABC transporter, ATP-binding protein  37.52 
 
 
626 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0243  ABC transporter, ATP-binding protein  36.58 
 
 
626 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.592514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>