More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0961 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  100 
 
 		 641 aa  1305    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 662 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  40.81 
 
 		 658 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  40.81 
 
 		 658 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 658 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  40.97 
 
 		 640 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 		 644 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  40.81 
 
 		 658 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  40.81 
 
 		 644 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  40.81 
 
 		 659 aa  458  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 		 659 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  40.5 
 
 		 658 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  39.18 
 
 		 644 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  38.35 
 
 		 645 aa  434  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 641 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  37.46 
 
 		 642 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  37.12 
 
 		 634 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  37.46 
 
 		 642 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  40.09 
 
 		 630 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  37.48 
 
 		 636 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  37.33 
 
 		 666 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  37.76 
 
 		 635 aa  403  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 		 636 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 644 aa  394  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  37.03 
 
 		 639 aa  393  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  38.41 
 
 		 638 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  36.82 
 
 		 639 aa  386  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  34.64 
 
 		 643 aa  386  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  36.83 
 
 		 638 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  35.01 
 
 		 646 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2293  ABC transporter related  36.04 
 
 		 613 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  40.26 
 
 		 564 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  36.44 
 
 		 643 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  33.38 
 
 		 649 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  35.91 
 
 		 627 aa  364  2e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  36.57 
 
 		 767 aa  365  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  40.19 
 
 		 575 aa  364  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 643 aa  363  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  39.32 
 
 		 581 aa  362  8e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  34.02 
 
 		 620 aa  362  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  40.45 
 
 		 567 aa  361  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  38.67 
 
 		 634 aa  360  4e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  33.68 
 
 		 657 aa  355  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  38.7 
 
 		 541 aa  355  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  35.17 
 
 		 668 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  38.81 
 
 		 540 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  38.62 
 
 		 541 aa  352  2e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  34.23 
 
 		 663 aa  351  3e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  38.96 
 
 		 569 aa  350  3e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  34.23 
 
 		 663 aa  350  5e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  34.85 
 
 		 685 aa  348  1e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  36.48 
 
 		 690 aa  349  1e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  34.21 
 
 		 659 aa  348  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  39.51 
 
 		 564 aa  348  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  34.39 
 
 		 632 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  39.63 
 
 		 572 aa  347  4e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  38.62 
 
 		 536 aa  347  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 		 632 aa  346  7e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.21 
 
 		 709 aa  344  2e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  35.02 
 
 		 636 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  39.25 
 
 		 572 aa  344  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  33.95 
 
 		 630 aa  344  2.9999999999999997e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  32.55 
 
 		 645 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  34.19 
 
 		 649 aa  343  5.999999999999999e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  36.05 
 
 		 641 aa  342  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  35.17 
 
 		 638 aa  341  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  34.31 
 
 		 656 aa  341  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  34 
 
 		 659 aa  340  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  36.62 
 
 		 650 aa  340  5e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  35.78 
 
 		 535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  34.74 
 
 		 652 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  33.12 
 
 		 645 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4548  ABC transporter related protein  31.92 
 
 		 644 aa  333  7.000000000000001e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  36.03 
 
 		 544 aa  331  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  36.12 
 
 		 574 aa  330  4e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  31.87 
 
 		 672 aa  329  8e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  36.13 
 
 		 575 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  35.56 
 
 		 640 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  36.51 
 
 		 656 aa  327  3e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  33.17 
 
 		 641 aa  326  7e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  34.49 
 
 		 642 aa  326  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  35.66 
 
 		 653 aa  325  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  32.57 
 
 		 667 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  36.73 
 
 		 652 aa  324  3e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  33.66 
 
 		 651 aa  323  5e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  33.21 
 
 		 545 aa  321  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  36.8 
 
 		 641 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  32.91 
 
 		 649 aa  320  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0373  ATPase  36.4 
 
 		 583 aa  318  2e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  33.49 
 
 		 643 aa  318  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  32.69 
 
 		 648 aa  318  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  34.43 
 
 		 650 aa  317  4e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  34.43 
 
 		 540 aa  317  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  32.8 
 
 		 648 aa  316  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  36.02 
 
 		 574 aa  316  9e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  33.33 
 
 		 540 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  33.82 
 
 		 549 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 546 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  33.85 
 
 		 540 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  34.24 
 
 		 540 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>