More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2038 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  57.03 
 
 		 645 aa  715    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  57.7 
 
 		 645 aa  716    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  100 
 
 		 642 aa  1294    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  57.98 
 
 		 641 aa  696    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  55.25 
 
 		 648 aa  681    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  55.56 
 
 		 648 aa  681    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  54.46 
 
 		 649 aa  679    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  56.22 
 
 		 649 aa  716    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  55.43 
 
 		 641 aa  580  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  41.73 
 
 		 668 aa  521  1e-146  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  40.54 
 
 		 690 aa  498  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 		 663 aa  488  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  39.94 
 
 		 646 aa  485  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  41.56 
 
 		 767 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 		 663 aa  485  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  41.82 
 
 		 644 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  39.35 
 
 		 709 aa  479  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  46.3 
 
 		 549 aa  477  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  41.03 
 
 		 672 aa  474  1e-132  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  39.51 
 
 		 685 aa  475  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 632 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  46.07 
 
 		 542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  39.56 
 
 		 636 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  45.09 
 
 		 664 aa  469  9.999999999999999e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  42.37 
 
 		 641 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  45.42 
 
 		 544 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1403  ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 		 667 aa  461  9.999999999999999e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 656 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  45.13 
 
 		 543 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  43.81 
 
 		 543 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  44.01 
 
 		 540 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  40.33 
 
 		 650 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 		 545 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  40.75 
 
 		 630 aa  456  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  44.19 
 
 		 540 aa  458  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.9 
 
 		 645 aa  454  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  38.24 
 
 		 638 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  44.16 
 
 		 545 aa  450  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  38.24 
 
 		 659 aa  451  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  40.06 
 
 		 652 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  38.24 
 
 		 658 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  39.32 
 
 		 659 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  38.08 
 
 		 658 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  38.24 
 
 		 658 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 658 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  38.08 
 
 		 644 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  38.08 
 
 		 640 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  38.08 
 
 		 658 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 662 aa  443  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 636 aa  444  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 644 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  40.63 
 
 		 651 aa  441  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 		 546 aa  440  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  39.5 
 
 		 639 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  40.82 
 
 		 667 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  42.72 
 
 		 564 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  42.29 
 
 		 535 aa  437  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  43.96 
 
 		 653 aa  436  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  39.37 
 
 		 656 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  42.53 
 
 		 581 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  37.63 
 
 		 667 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  40.37 
 
 		 544 aa  432  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  42.34 
 
 		 575 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  40.36 
 
 		 652 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  36.87 
 
 		 643 aa  432  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  40.87 
 
 		 545 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  38.08 
 
 		 637 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  38.85 
 
 		 638 aa  425  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 688 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  39.58 
 
 		 650 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  37.13 
 
 		 645 aa  424  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  44.05 
 
 		 567 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  42.8 
 
 		 564 aa  422  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  38.99 
 
 		 635 aa  422  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  44 
 
 		 536 aa  418  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  35.49 
 
 		 642 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  40.11 
 
 		 540 aa  419  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  35.49 
 
 		 642 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  42.23 
 
 		 540 aa  413  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  41.29 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  34.88 
 
 		 634 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.85 
 
 		 541 aa  412  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  38.99 
 
 		 536 aa  412  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  36.86 
 
 		 643 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  40.91 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  35.43 
 
 		 643 aa  410  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  33.28 
 
 		 639 aa  409  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  33.78 
 
 		 666 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  42.23 
 
 		 540 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  40.34 
 
 		 540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  43.67 
 
 		 569 aa  405  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  40.53 
 
 		 540 aa  405  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  37.52 
 
 		 541 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  40.53 
 
 		 540 aa  405  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  40.72 
 
 		 540 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  41.29 
 
 		 548 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  41.1 
 
 		 548 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  37.9 
 
 		 541 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  37.09 
 
 		 634 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  41.23 
 
 		 574 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>