More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2727 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  55.66 
 
 
632 aa  653    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  100 
 
 
649 aa  1329    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  52.05 
 
 
659 aa  635    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  51.36 
 
 
659 aa  627  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  37.75 
 
 
636 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  38.22 
 
 
644 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  35.88 
 
 
645 aa  428  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  37.12 
 
 
641 aa  425  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  36.74 
 
 
636 aa  412  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  37.48 
 
 
640 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  37.4 
 
 
634 aa  415  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  37.77 
 
 
635 aa  416  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 
644 aa  409  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  36.4 
 
 
666 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  39.63 
 
 
634 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  36.67 
 
 
639 aa  410  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  36.09 
 
 
659 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  38.02 
 
 
638 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  36.39 
 
 
659 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  39.34 
 
 
767 aa  405  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  36.17 
 
 
644 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  35.41 
 
 
662 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  35.68 
 
 
658 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
658 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 
658 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
658 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 
640 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 
644 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  35.54 
 
 
649 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  36.69 
 
 
620 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  36.79 
 
 
649 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  35.22 
 
 
658 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  35.19 
 
 
642 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  35.19 
 
 
642 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  34.66 
 
 
627 aa  390  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  34.76 
 
 
643 aa  390  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  35.62 
 
 
638 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  38.26 
 
 
657 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  35.53 
 
 
638 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  35.43 
 
 
630 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4548  ABC transporter related protein  35.9 
 
 
644 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  33.74 
 
 
632 aa  381  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  38.64 
 
 
643 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
643 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  33.08 
 
 
639 aa  374  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  33.64 
 
 
641 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  34.28 
 
 
667 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  34.8 
 
 
641 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  33.98 
 
 
645 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  35.7 
 
 
645 aa  364  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  33.33 
 
 
646 aa  362  8e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2293  ABC transporter related  39.52 
 
 
613 aa  362  9e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  38.03 
 
 
690 aa  361  3e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  34.62 
 
 
636 aa  361  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  33.04 
 
 
668 aa  358  9.999999999999999e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  37.43 
 
 
540 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  37.43 
 
 
540 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  33.89 
 
 
651 aa  357  2.9999999999999997e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.74 
 
 
645 aa  357  3.9999999999999996e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  34.45 
 
 
650 aa  357  5e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  37.45 
 
 
545 aa  357  5.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  36.88 
 
 
540 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  36.45 
 
 
535 aa  355  2e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  34.39 
 
 
632 aa  355  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  32.69 
 
 
663 aa  353  4e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  38.49 
 
 
542 aa  354  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  33.84 
 
 
630 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  32.54 
 
 
663 aa  351  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5082  ABC transporter, ATP-binding protein  36.01 
 
 
626 aa  350  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0119916  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  37.25 
 
 
540 aa  349  8e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  37.25 
 
 
540 aa  349  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  37.98 
 
 
540 aa  348  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  37.25 
 
 
540 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  36.88 
 
 
540 aa  347  5e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  37.32 
 
 
540 aa  346  7e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  36.4 
 
 
540 aa  346  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  33.38 
 
 
637 aa  346  8.999999999999999e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  36.98 
 
 
575 aa  346  8.999999999999999e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  33.79 
 
 
650 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  34.57 
 
 
641 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0204  ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 
626 aa  345  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  36.88 
 
 
539 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  37.7 
 
 
569 aa  344  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  31.86 
 
 
672 aa  343  5e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  38.33 
 
 
574 aa  343  5e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0238  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 
626 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  33.23 
 
 
643 aa  343  5.999999999999999e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 
540 aa  343  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  36.25 
 
 
581 aa  343  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0262  ABC transporter, ATP-binding protein  36.2 
 
 
626 aa  343  8e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0245  ABC transporter, ATP-binding protein  36.2 
 
 
626 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  32.34 
 
 
685 aa  342  1e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  32.83 
 
 
636 aa  342  1e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0217  ABC transporter ATP-binding protein  35.15 
 
 
626 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  36.3 
 
 
653 aa  342  2e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  36.99 
 
 
544 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0228  ABC transporter ATP-binding protein  35.15 
 
 
626 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  36.88 
 
 
540 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  36.5 
 
 
543 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  32.06 
 
 
629 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>