More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1158 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  61.31 
 
 
636 aa  773    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  52.62 
 
 
658 aa  640    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  52.46 
 
 
658 aa  638    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  52.46 
 
 
658 aa  638    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  53.24 
 
 
659 aa  637    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  52.78 
 
 
640 aa  641    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  51.64 
 
 
645 aa  675    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  52.62 
 
 
658 aa  640    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  100 
 
 
635 aa  1287    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  61.03 
 
 
639 aa  763    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  55.77 
 
 
644 aa  640    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  52.66 
 
 
644 aa  629  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  51.66 
 
 
662 aa  629  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  52.67 
 
 
658 aa  629  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  51.82 
 
 
644 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  53.2 
 
 
659 aa  621  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  55.8 
 
 
641 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  48.5 
 
 
636 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  46.74 
 
 
642 aa  572  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  46.74 
 
 
642 aa  572  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  43.96 
 
 
643 aa  559  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 
644 aa  555  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  46.48 
 
 
638 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  41.44 
 
 
634 aa  497  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  41.03 
 
 
666 aa  490  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  42.31 
 
 
630 aa  475  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  42.83 
 
 
638 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  38.18 
 
 
639 aa  449  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  40.1 
 
 
649 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  39.21 
 
 
620 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  41.43 
 
 
634 aa  429  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  37.98 
 
 
649 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  41.09 
 
 
641 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  39.33 
 
 
767 aa  425  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  41.09 
 
 
645 aa  422  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.99 
 
 
645 aa  419  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  40.65 
 
 
640 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  41.64 
 
 
643 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  42.01 
 
 
643 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  41 
 
 
648 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  40.64 
 
 
648 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  38.88 
 
 
657 aa  415  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  37.3 
 
 
649 aa  409  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 
645 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  36.21 
 
 
641 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  39.77 
 
 
581 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  37.76 
 
 
641 aa  403  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  38.35 
 
 
668 aa  404  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  40.84 
 
 
672 aa  404  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  40.19 
 
 
575 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  39.81 
 
 
564 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  39.55 
 
 
690 aa  398  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  35.66 
 
 
627 aa  395  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  37.16 
 
 
630 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  40.75 
 
 
709 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  38.92 
 
 
641 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  37.12 
 
 
632 aa  391  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  40.64 
 
 
542 aa  392  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  39.48 
 
 
569 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  41.05 
 
 
567 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  38.95 
 
 
637 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
643 aa  383  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  38.29 
 
 
549 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  40.34 
 
 
564 aa  381  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  36.52 
 
 
667 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  37.21 
 
 
659 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  37.01 
 
 
544 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0238  ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
626 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  38.63 
 
 
543 aa  379  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  38.24 
 
 
540 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  37.67 
 
 
540 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  40.15 
 
 
642 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  38.15 
 
 
544 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  34.47 
 
 
632 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  39.48 
 
 
543 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  37.11 
 
 
541 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  38.48 
 
 
540 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  36.73 
 
 
541 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 
545 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  36.07 
 
 
659 aa  372  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  38.05 
 
 
540 aa  372  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0217  ABC transporter ATP-binding protein  36.92 
 
 
626 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0204  ABC transporter, ATP-binding protein  37.83 
 
 
626 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0228  ABC transporter ATP-binding protein  36.92 
 
 
626 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  36.32 
 
 
638 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  38.48 
 
 
540 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  37.52 
 
 
540 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  35.49 
 
 
636 aa  369  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  37.71 
 
 
540 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 
546 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  36.75 
 
 
540 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0262  ABC transporter, ATP-binding protein  37.65 
 
 
626 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.68 
 
 
541 aa  365  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0245  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 
626 aa  365  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  35.74 
 
 
656 aa  365  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  38.88 
 
 
560 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  36.19 
 
 
536 aa  364  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  37.52 
 
 
540 aa  364  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  36.95 
 
 
540 aa  364  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  37.9 
 
 
540 aa  363  6e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>