More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0024 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  100 
 
 
627 aa  1243    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  59.9 
 
 
641 aa  713    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  38.58 
 
 
658 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  38.73 
 
 
658 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  38.62 
 
 
640 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  38.37 
 
 
659 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 
658 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 
658 aa  445  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 
662 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 
644 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  39.56 
 
 
634 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  37.75 
 
 
644 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  37.96 
 
 
658 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 
644 aa  435  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  40.07 
 
 
659 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  36.48 
 
 
641 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  34.84 
 
 
645 aa  418  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  35.48 
 
 
620 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  37.33 
 
 
639 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 
636 aa  405  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  37.05 
 
 
636 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  39.2 
 
 
638 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  37.08 
 
 
639 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  35.66 
 
 
635 aa  395  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  38.74 
 
 
630 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  40.28 
 
 
643 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  38.56 
 
 
640 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  34.94 
 
 
643 aa  383  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 
643 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  34.36 
 
 
649 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  34.53 
 
 
666 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  37.66 
 
 
638 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  35.2 
 
 
767 aa  375  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  38.42 
 
 
634 aa  372  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  35.89 
 
 
638 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  35.91 
 
 
641 aa  364  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  34.9 
 
 
632 aa  362  1e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  34.97 
 
 
636 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  39.69 
 
 
535 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  34.51 
 
 
642 aa  355  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  34.51 
 
 
642 aa  355  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.57 
 
 
709 aa  353  5.9999999999999994e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  32.74 
 
 
632 aa  350  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  33.65 
 
 
646 aa  349  7e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  34.05 
 
 
629 aa  349  9e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.26 
 
 
668 aa  348  1e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0205  ABC transporter related  36.53 
 
 
628 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 
644 aa  344  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  31.89 
 
 
672 aa  343  4e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  34.06 
 
 
564 aa  343  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  36.1 
 
 
656 aa  343  7e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  32.18 
 
 
649 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0238  ABC transporter, ATP-binding protein  36.38 
 
 
626 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  37.55 
 
 
667 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  33.77 
 
 
642 aa  339  7e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  33.9 
 
 
639 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  32.56 
 
 
667 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  33.58 
 
 
690 aa  337  2.9999999999999997e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  34.45 
 
 
581 aa  337  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  33.13 
 
 
632 aa  336  7e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5082  ABC transporter, ATP-binding protein  34.68 
 
 
626 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0119916  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0217  ABC transporter ATP-binding protein  35.88 
 
 
626 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0228  ABC transporter ATP-binding protein  35.88 
 
 
626 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0245  ABC transporter, ATP-binding protein  35.39 
 
 
626 aa  334  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0262  ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 
626 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  34.04 
 
 
640 aa  333  7.000000000000001e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0204  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
626 aa  331  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0243  ABC transporter, ATP-binding protein  35.38 
 
 
626 aa  330  6e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.592514  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  34.25 
 
 
549 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  34.73 
 
 
569 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  34.36 
 
 
657 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  35.33 
 
 
641 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  33.49 
 
 
630 aa  327  5e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  33.39 
 
 
630 aa  326  6e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  29.9 
 
 
659 aa  326  7e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.55 
 
 
557 aa  326  8.000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  34.88 
 
 
567 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  33.27 
 
 
540 aa  325  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  31.58 
 
 
649 aa  325  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  31.17 
 
 
629 aa  324  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.36 
 
 
557 aa  323  4e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  33.08 
 
 
630 aa  323  5e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  32.55 
 
 
545 aa  323  6e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  32.28 
 
 
659 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  34.09 
 
 
645 aa  321  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  30.66 
 
 
626 aa  321  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  33.51 
 
 
574 aa  321  3e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  33.02 
 
 
622 aa  321  3e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0929  ABC transporter related  32.12 
 
 
714 aa  321  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.526225  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  32.53 
 
 
540 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  32.4 
 
 
540 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  33.06 
 
 
643 aa  320  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  32.05 
 
 
641 aa  320  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  35.12 
 
 
536 aa  320  6e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  30.43 
 
 
645 aa  320  6e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  33.1 
 
 
574 aa  320  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
663 aa  319  1e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  33.44 
 
 
631 aa  318  1e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  32.6 
 
 
575 aa  319  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  32.53 
 
 
540 aa  319  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>