More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3313 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0245  ABC transporter, ATP-binding protein  57.17 
 
 
626 aa  684    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0262  ABC transporter, ATP-binding protein  57.17 
 
 
626 aa  682    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0217  ABC transporter ATP-binding protein  56.99 
 
 
626 aa  688    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0243  ABC transporter, ATP-binding protein  57.88 
 
 
626 aa  684    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.592514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0204  ABC transporter, ATP-binding protein  56.99 
 
 
626 aa  685    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0238  ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 
626 aa  684    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0228  ABC transporter ATP-binding protein  56.99 
 
 
626 aa  688    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  100 
 
 
636 aa  1302    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0205  ABC transporter related  56.49 
 
 
628 aa  670    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5082  ABC transporter, ATP-binding protein  56.36 
 
 
626 aa  687    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0119916  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0208  ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 
470 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  45.37 
 
 
640 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  34.92 
 
 
639 aa  427  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  36.49 
 
 
634 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  41.04 
 
 
644 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  40.62 
 
 
659 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  37.1 
 
 
641 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  36.91 
 
 
658 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 
640 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  41.32 
 
 
636 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  37.99 
 
 
643 aa  389  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  37.07 
 
 
658 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  36.91 
 
 
658 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  36.91 
 
 
658 aa  389  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  36.91 
 
 
658 aa  389  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  37.01 
 
 
659 aa  385  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  38.57 
 
 
634 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 
644 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  36.68 
 
 
644 aa  382  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  38.97 
 
 
662 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  37.72 
 
 
659 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  37.25 
 
 
620 aa  379  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  37.15 
 
 
666 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  35.08 
 
 
639 aa  376  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 
636 aa  375  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  39.93 
 
 
630 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  35.42 
 
 
645 aa  372  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  38.04 
 
 
638 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  39.49 
 
 
643 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  39.67 
 
 
643 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  35.57 
 
 
659 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  35.49 
 
 
635 aa  369  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  35.88 
 
 
767 aa  362  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4945  ABC transporter related  37.5 
 
 
561 aa  360  3e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  34.97 
 
 
627 aa  360  3e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  36.17 
 
 
632 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  37.39 
 
 
549 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.23 
 
 
645 aa  357  5e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  35.73 
 
 
642 aa  355  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  35.73 
 
 
642 aa  355  1e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  36.73 
 
 
544 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  36.12 
 
 
543 aa  350  6e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  34.47 
 
 
644 aa  349  8e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
545 aa  349  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  34.03 
 
 
649 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  35.79 
 
 
542 aa  345  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  35.02 
 
 
641 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  36.45 
 
 
641 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  35.26 
 
 
668 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  37.08 
 
 
581 aa  343  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  36.07 
 
 
540 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  35.45 
 
 
631 aa  342  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  36.82 
 
 
649 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  36.07 
 
 
540 aa  340  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  37.55 
 
 
672 aa  338  2.9999999999999997e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  35.01 
 
 
690 aa  336  7e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  34.44 
 
 
543 aa  335  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  35.21 
 
 
540 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  35.82 
 
 
657 aa  334  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  33.55 
 
 
643 aa  334  3e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  35.93 
 
 
575 aa  333  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  35.48 
 
 
564 aa  332  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 
545 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  36.67 
 
 
645 aa  331  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  34.65 
 
 
638 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2293  ABC transporter related  38.66 
 
 
613 aa  330  7e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  37.17 
 
 
567 aa  329  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  35.71 
 
 
540 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  36.08 
 
 
541 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  33.7 
 
 
622 aa  328  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  34.24 
 
 
619 aa  327  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  34.27 
 
 
540 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  36.09 
 
 
548 aa  326  7e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  35.14 
 
 
540 aa  325  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  33.55 
 
 
630 aa  325  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  33.64 
 
 
667 aa  325  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 
645 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  35.73 
 
 
536 aa  325  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  32.88 
 
 
640 aa  325  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  35.9 
 
 
548 aa  324  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  36.28 
 
 
540 aa  323  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  36.06 
 
 
569 aa  323  5e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  35.71 
 
 
548 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.42 
 
 
541 aa  323  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  36.12 
 
 
545 aa  323  6e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.95 
 
 
709 aa  323  6e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  35.39 
 
 
540 aa  323  7e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  35.53 
 
 
541 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  37.38 
 
 
545 aa  322  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  34.46 
 
 
540 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>