More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0719 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  51.26 
 
 		 668 aa  669    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  51.11 
 
 		 690 aa  669    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  100 
 
 		 672 aa  1377    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  52.09 
 
 		 709 aa  670    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 		 663 aa  543  1e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 663 aa  543  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  42.71 
 
 		 685 aa  542  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  43.23 
 
 		 641 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 645 aa  485  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  44.92 
 
 		 549 aa  478  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  40.75 
 
 		 649 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  41.19 
 
 		 645 aa  478  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  39.67 
 
 		 649 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  39.07 
 
 		 632 aa  461  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 		 545 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  46.21 
 
 		 536 aa  455  1.0000000000000001e-126  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  43.59 
 
 		 540 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  42.94 
 
 		 542 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  42.57 
 
 		 544 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  43.41 
 
 		 540 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  40.06 
 
 		 648 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  39.91 
 
 		 648 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  42.12 
 
 		 543 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  41.48 
 
 		 545 aa  442  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  41.83 
 
 		 543 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  41.83 
 
 		 540 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  42.37 
 
 		 540 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  42.18 
 
 		 540 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  42.37 
 
 		 540 aa  435  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  42.97 
 
 		 565 aa  434  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  38.58 
 
 		 767 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  37.35 
 
 		 646 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  42.16 
 
 		 540 aa  432  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  41.6 
 
 		 540 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  37.16 
 
 		 643 aa  431  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  43.76 
 
 		 619 aa  426  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  38.96 
 
 		 630 aa  426  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  42 
 
 		 540 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  41.6 
 
 		 540 aa  429  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  41.21 
 
 		 535 aa  428  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  43.33 
 
 		 641 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  42.02 
 
 		 560 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  42.37 
 
 		 539 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  41.63 
 
 		 540 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  41.81 
 
 		 540 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  41.6 
 
 		 540 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  42 
 
 		 540 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  36.47 
 
 		 664 aa  425  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  41.04 
 
 		 540 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.21 
 
 		 541 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  37.19 
 
 		 688 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  41.6 
 
 		 540 aa  422  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  38.28 
 
 		 667 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  41.23 
 
 		 540 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  40.86 
 
 		 548 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  37.41 
 
 		 638 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  42.53 
 
 		 637 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  40.42 
 
 		 545 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  37.95 
 
 		 656 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  40.3 
 
 		 548 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  40.49 
 
 		 548 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.1 
 
 		 637 aa  411  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.9 
 
 		 639 aa  412  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  35.01 
 
 		 634 aa  412  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.42 
 
 		 635 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  39.4 
 
 		 540 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 		 659 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  36.71 
 
 		 637 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  36.71 
 
 		 637 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 		 636 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 637 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 		 658 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  41.51 
 
 		 564 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 637 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 658 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  41.64 
 
 		 581 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  36.81 
 
 		 640 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  36.71 
 
 		 637 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 637 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.83 
 
 		 635 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 635 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  42.06 
 
 		 575 aa  406  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 		 637 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  41.6 
 
 		 540 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  36.88 
 
 		 644 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 637 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.67 
 
 		 635 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  36.47 
 
 		 638 aa  405  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.8 
 
 		 645 aa  405  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  36.79 
 
 		 658 aa  405  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.88 
 
 		 637 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  35.09 
 
 		 666 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.52 
 
 		 635 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  37.14 
 
 		 644 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 637 aa  405  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  36.81 
 
 		 644 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 		 640 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  37.33 
 
 		 659 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.52 
 
 		 635 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  35.97 
 
 		 639 aa  404  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>