More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2093 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 545 aa  1114    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  83.86 
 
 		 540 aa  953    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  85.47 
 
 		 543 aa  957    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  83.86 
 
 		 540 aa  957    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  74.49 
 
 		 549 aa  854    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  86.88 
 
 		 544 aa  981    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  85.56 
 
 		 543 aa  970    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  81.45 
 
 		 542 aa  914    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  52.89 
 
 		 540 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  53.42 
 
 		 545 aa  578  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  53.43 
 
 		 540 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  53.25 
 
 		 540 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  54.55 
 
 		 540 aa  578  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  53.06 
 
 		 540 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  53.63 
 
 		 548 aa  571  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  53.82 
 
 		 548 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  53.26 
 
 		 548 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  53.43 
 
 		 540 aa  570  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  53.26 
 
 		 540 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  52.89 
 
 		 545 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  53.62 
 
 		 540 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  52.5 
 
 		 540 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  53.45 
 
 		 540 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  52.33 
 
 		 540 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  51.95 
 
 		 540 aa  557  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  52.89 
 
 		 539 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  51.95 
 
 		 560 aa  548  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  53.43 
 
 		 540 aa  550  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  52.88 
 
 		 540 aa  551  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.76 
 
 		 541 aa  547  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  52.14 
 
 		 540 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  52.13 
 
 		 540 aa  543  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  50.65 
 
 		 565 aa  540  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  45.93 
 
 		 690 aa  481  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 663 aa  465  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 663 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  44.16 
 
 		 668 aa  460  9.999999999999999e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  42.62 
 
 		 685 aa  458  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  42.6 
 
 		 672 aa  453  1.0000000000000001e-126  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  44.05 
 
 		 645 aa  450  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  44.53 
 
 		 641 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  44.8 
 
 		 709 aa  446  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  43.85 
 
 		 649 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 		 645 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  42.75 
 
 		 649 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  43.28 
 
 		 641 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  41.49 
 
 		 653 aa  426  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  41.01 
 
 		 651 aa  424  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  43.87 
 
 		 648 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  43.49 
 
 		 648 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  42.59 
 
 		 564 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  42.07 
 
 		 575 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  41.11 
 
 		 581 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  39.96 
 
 		 652 aa  412  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  44.76 
 
 		 642 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  42.57 
 
 		 567 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  40.07 
 
 		 650 aa  411  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  41.1 
 
 		 650 aa  411  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  39.93 
 
 		 652 aa  412  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  39.33 
 
 		 632 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  42.7 
 
 		 564 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  39.86 
 
 		 656 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  41.41 
 
 		 767 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  40.3 
 
 		 638 aa  403  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  39.29 
 
 		 643 aa  404  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  42.44 
 
 		 569 aa  403  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  40.04 
 
 		 664 aa  399  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  39.31 
 
 		 644 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  39.93 
 
 		 630 aa  398  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  39.18 
 
 		 645 aa  397  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  41.53 
 
 		 574 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  42.13 
 
 		 667 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  39.74 
 
 		 667 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  37.1 
 
 		 643 aa  393  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.48 
 
 		 645 aa  389  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  41.18 
 
 		 574 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  39.78 
 
 		 536 aa  388  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 656 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  38.59 
 
 		 637 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  39.42 
 
 		 545 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  40.55 
 
 		 575 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  37.36 
 
 		 634 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  38.29 
 
 		 636 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  38.94 
 
 		 641 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  37.08 
 
 		 646 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  37.07 
 
 		 666 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  36.38 
 
 		 535 aa  374  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  36.76 
 
 		 659 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  37.59 
 
 		 638 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  37.75 
 
 		 688 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  39.34 
 
 		 619 aa  371  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  38.65 
 
 		 634 aa  372  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  38.22 
 
 		 640 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  38.98 
 
 		 544 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  38.58 
 
 		 635 aa  371  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  38.75 
 
 		 572 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  39.04 
 
 		 638 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  36.1 
 
 		 541 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  35.91 
 
 		 541 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  39.74 
 
 		 632 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>