More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1536 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  83.86 
 
 		 545 aa  953    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  100 
 
 		 540 aa  1100    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  84.04 
 
 		 543 aa  955    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  73 
 
 		 549 aa  841    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  84.94 
 
 		 544 aa  964    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  80 
 
 		 542 aa  912    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  98.89 
 
 		 540 aa  1092    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  84.17 
 
 		 543 aa  947    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  52.39 
 
 		 545 aa  566  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  52.89 
 
 		 540 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  52.89 
 
 		 540 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  53.45 
 
 		 540 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  52.51 
 
 		 540 aa  558  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  52.89 
 
 		 540 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  51.02 
 
 		 540 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  52.33 
 
 		 540 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  51.96 
 
 		 540 aa  556  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  51.02 
 
 		 548 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  51.95 
 
 		 540 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  50.84 
 
 		 548 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  51.02 
 
 		 545 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  51.02 
 
 		 548 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  51.39 
 
 		 539 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  52.13 
 
 		 540 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  51.76 
 
 		 540 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  52.51 
 
 		 540 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  52.33 
 
 		 540 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  51.4 
 
 		 560 aa  538  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  51.21 
 
 		 540 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  51.77 
 
 		 540 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  52.14 
 
 		 540 aa  537  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.02 
 
 		 541 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  50.65 
 
 		 565 aa  531  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  43.76 
 
 		 690 aa  459  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  44.51 
 
 		 668 aa  461  9.999999999999999e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 663 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 		 663 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  45.35 
 
 		 645 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  43.41 
 
 		 672 aa  450  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  41.76 
 
 		 685 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  43.87 
 
 		 641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  43.2 
 
 		 645 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  42.83 
 
 		 649 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  43.46 
 
 		 649 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  42.44 
 
 		 653 aa  438  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  44.15 
 
 		 709 aa  435  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  41.49 
 
 		 651 aa  425  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  40.95 
 
 		 650 aa  419  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  40.95 
 
 		 652 aa  419  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  42.24 
 
 		 641 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  43.36 
 
 		 648 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  43.36 
 
 		 648 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  40.51 
 
 		 652 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  44.19 
 
 		 642 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  41.27 
 
 		 656 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  40.45 
 
 		 581 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  42.47 
 
 		 767 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  39.89 
 
 		 632 aa  411  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  41.57 
 
 		 638 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  39.71 
 
 		 650 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  39.96 
 
 		 564 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  39.96 
 
 		 664 aa  400  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  39.93 
 
 		 644 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  40.15 
 
 		 645 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  39.59 
 
 		 575 aa  402  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  38.4 
 
 		 643 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  40.33 
 
 		 567 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  39.33 
 
 		 536 aa  392  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  41.01 
 
 		 667 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  38.22 
 
 		 637 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.03 
 
 		 645 aa  392  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 656 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  37.05 
 
 		 643 aa  390  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  40.56 
 
 		 564 aa  385  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  38.82 
 
 		 630 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  40.22 
 
 		 569 aa  386  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  36.45 
 
 		 535 aa  382  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  38.85 
 
 		 636 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  38.33 
 
 		 666 aa  382  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  40.11 
 
 		 574 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  36.16 
 
 		 659 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  39.02 
 
 		 667 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  37.62 
 
 		 638 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  39.56 
 
 		 641 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  38.31 
 
 		 545 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  39.4 
 
 		 634 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  38.98 
 
 		 544 aa  373  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  37.2 
 
 		 646 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  38.97 
 
 		 619 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  39.48 
 
 		 632 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  36.9 
 
 		 634 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  38.48 
 
 		 635 aa  370  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  39.14 
 
 		 643 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  39.66 
 
 		 638 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  35.66 
 
 		 541 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  35.73 
 
 		 541 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  38.29 
 
 		 640 aa  365  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1403  ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 		 667 aa  365  2e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 		 658 aa  364  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  36.16 
 
 		 658 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>