More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0996 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  100 
 
 
536 aa  1105    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  51.67 
 
 
619 aa  547  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  46.31 
 
 
668 aa  483  1e-135  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  44.92 
 
 
690 aa  469  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  46.21 
 
 
672 aa  470  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 
663 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  44.72 
 
 
663 aa  465  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  44.91 
 
 
685 aa  462  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  46.05 
 
 
709 aa  457  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  41.82 
 
 
545 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  45.85 
 
 
667 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 
645 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  43.26 
 
 
645 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  41.37 
 
 
549 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  41.57 
 
 
540 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  40.53 
 
 
560 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  41.65 
 
 
540 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  41.48 
 
 
632 aa  426  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  41.65 
 
 
548 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  41.46 
 
 
548 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  41.46 
 
 
548 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.28 
 
 
541 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
641 aa  420  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  41.09 
 
 
540 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  40.53 
 
 
540 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  40.89 
 
 
544 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  40.9 
 
 
540 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  40.71 
 
 
565 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  43.05 
 
 
649 aa  419  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  41.01 
 
 
540 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  41.2 
 
 
540 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  39.96 
 
 
540 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  42.3 
 
 
649 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  40.07 
 
 
540 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  39.33 
 
 
540 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  39.59 
 
 
540 aa  411  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  41.46 
 
 
540 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  39.77 
 
 
540 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  39.77 
 
 
540 aa  411  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  39.77 
 
 
540 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  39.52 
 
 
540 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  40.99 
 
 
656 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  40.34 
 
 
540 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  38.85 
 
 
543 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  39.77 
 
 
539 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  39.78 
 
 
545 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  39.63 
 
 
543 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  39.17 
 
 
646 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  39.4 
 
 
545 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  40.71 
 
 
664 aa  400  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  39.48 
 
 
542 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  40.86 
 
 
641 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  40.15 
 
 
540 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  42.03 
 
 
648 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  41.84 
 
 
648 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  38.68 
 
 
535 aa  394  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  38.99 
 
 
545 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  39.66 
 
 
638 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2038  ABC-type transport system, ATPase component  44 
 
 
642 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.628193  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  40.04 
 
 
581 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  40.86 
 
 
641 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  40.37 
 
 
644 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  39.1 
 
 
564 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  38.88 
 
 
688 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  40.44 
 
 
653 aa  381  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  39.6 
 
 
650 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.68 
 
 
637 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  37.48 
 
 
630 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  38.16 
 
 
666 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  39.44 
 
 
643 aa  373  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  37.96 
 
 
544 aa  371  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  40.55 
 
 
656 aa  371  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  38.46 
 
 
633 aa  372  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  38.59 
 
 
651 aa  370  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  38.56 
 
 
637 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.55 
 
 
645 aa  366  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 
634 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  39.71 
 
 
652 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.34 
 
 
635 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  38 
 
 
636 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  39.67 
 
 
652 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  38.97 
 
 
650 aa  364  2e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  37.96 
 
 
635 aa  364  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  39.81 
 
 
767 aa  364  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  39.06 
 
 
645 aa  363  3e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  39.92 
 
 
569 aa  363  3e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  37.48 
 
 
575 aa  364  3e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  37.57 
 
 
648 aa  363  4e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 
639 aa  363  6e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  38.05 
 
 
667 aa  362  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  37.45 
 
 
636 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.96 
 
 
635 aa  361  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  38.39 
 
 
633 aa  361  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  38.58 
 
 
659 aa  361  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  39.5 
 
 
672 aa  361  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  39.23 
 
 
615 aa  361  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  36.19 
 
 
541 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  38.61 
 
 
567 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  36.65 
 
 
634 aa  360  4e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  36.99 
 
 
536 aa  359  7e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>