More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2379 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0250  ATPase  69.48 
 
 		 662 aa  936    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1761  ABC transporter related  54.09 
 
 		 647 aa  719    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1101  ABC transporter related  52.76 
 
 		 658 aa  656    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0871053  normal  0.0818517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2379  ABC transporter related  100 
 
 		 660 aa  1339    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2203  ABC transporter related  64.79 
 
 		 669 aa  864    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0324  ABC transporter related  76.67 
 
 		 659 aa  1046    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.843371  normal  0.526275 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  36.94 
 
 		 690 aa  396  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  36.41 
 
 		 668 aa  394  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.48 
 
 		 709 aa  376  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  36.9 
 
 		 636 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 663 aa  369  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  36.95 
 
 		 641 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  35.16 
 
 		 685 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 663 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  35.43 
 
 		 648 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  35.23 
 
 		 672 aa  369  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  33.23 
 
 		 643 aa  360  4e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  36.43 
 
 		 659 aa  360  7e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  35.73 
 
 		 644 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  38.48 
 
 		 543 aa  357  5e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.39 
 
 		 637 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  36.94 
 
 		 672 aa  356  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  37.22 
 
 		 636 aa  355  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 		 635 aa  353  4e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  38.89 
 
 		 542 aa  353  7e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.89 
 
 		 640 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.89 
 
 		 640 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.89 
 
 		 640 aa  351  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  35.92 
 
 		 641 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 		 635 aa  351  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  36.53 
 
 		 634 aa  350  4e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  37.21 
 
 		 643 aa  348  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.1 
 
 		 637 aa  348  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.51 
 
 		 639 aa  348  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  38.36 
 
 		 540 aa  347  5e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  38.4 
 
 		 544 aa  346  8.999999999999999e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  36.16 
 
 		 624 aa  345  1e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 		 545 aa  345  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  34.23 
 
 		 638 aa  343  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  36.83 
 
 		 640 aa  343  8e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 540 aa  343  8e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  32.21 
 
 		 632 aa  342  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  36.69 
 
 		 543 aa  342  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  37.13 
 
 		 549 aa  341  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  35.28 
 
 		 635 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3136  ABC transporter related  36.21 
 
 		 644 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  37.48 
 
 		 636 aa  340  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  36.69 
 
 		 635 aa  339  8e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  35.73 
 
 		 636 aa  339  9e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  36.96 
 
 		 548 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.91 
 
 		 541 aa  339  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 		 651 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  32.91 
 
 		 645 aa  338  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  33.98 
 
 		 667 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  36.44 
 
 		 643 aa  337  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.94 
 
 		 635 aa  336  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  33.7 
 
 		 636 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.94 
 
 		 635 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  36.8 
 
 		 540 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.94 
 
 		 635 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.94 
 
 		 635 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.94 
 
 		 635 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  38.14 
 
 		 659 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  36.77 
 
 		 548 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  33.33 
 
 		 627 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  31.51 
 
 		 644 aa  333  5e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  33.55 
 
 		 627 aa  333  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  32.26 
 
 		 642 aa  333  7.000000000000001e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  32.47 
 
 		 651 aa  333  7.000000000000001e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  32.26 
 
 		 642 aa  333  7.000000000000001e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  32.27 
 
 		 646 aa  333  8e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  36.59 
 
 		 548 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  33.18 
 
 		 688 aa  332  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  36.14 
 
 		 540 aa  332  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  34.14 
 
 		 649 aa  332  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.16 
 
 		 637 aa  332  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.99 
 
 		 637 aa  330  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  35.26 
 
 		 636 aa  330  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  33.55 
 
 		 619 aa  330  5.0000000000000004e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  34.06 
 
 		 767 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  33.99 
 
 		 637 aa  330  6e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  33.99 
 
 		 637 aa  330  6e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  38.62 
 
 		 633 aa  330  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  35.51 
 
 		 653 aa  330  6e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  33.99 
 
 		 637 aa  330  6e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.99 
 
 		 637 aa  330  6e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.99 
 
 		 637 aa  330  6e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.99 
 
 		 637 aa  330  6e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  34.96 
 
 		 646 aa  330  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  35.32 
 
 		 650 aa  329  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69340  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.16 
 
 		 638 aa  329  8e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  33.96 
 
 		 658 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  33.96 
 
 		 658 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  35.62 
 
 		 638 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.99 
 
 		 637 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  35.97 
 
 		 535 aa  329  1.0000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  33.96 
 
 		 640 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  36.62 
 
 		 540 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  37.97 
 
 		 536 aa  329  1.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  36.53 
 
 		 565 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>