More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0324 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0324  ABC transporter related  100 
 
 		 659 aa  1329    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.843371  normal  0.526275 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0250  ATPase  70.55 
 
 		 662 aa  937    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2379  ABC transporter related  76.67 
 
 		 660 aa  1046    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1761  ABC transporter related  54.6 
 
 		 647 aa  699    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2203  ABC transporter related  65.77 
 
 		 669 aa  873    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1101  ABC transporter related  52.79 
 
 		 658 aa  632  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0871053  normal  0.0818517 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  36.1 
 
 		 663 aa  376  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  36.26 
 
 		 663 aa  375  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  35.71 
 
 		 685 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.96 
 
 		 668 aa  372  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  34.56 
 
 		 690 aa  367  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.49 
 
 		 709 aa  363  5.0000000000000005e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  36.45 
 
 		 659 aa  360  6e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  34.64 
 
 		 672 aa  357  5e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  35 
 
 		 636 aa  353  5e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  33.71 
 
 		 638 aa  351  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  35.76 
 
 		 644 aa  347  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  37.35 
 
 		 672 aa  345  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  34.89 
 
 		 648 aa  345  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.71 
 
 		 541 aa  343  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  31.01 
 
 		 643 aa  342  9e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  35.9 
 
 		 641 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  37.48 
 
 		 560 aa  338  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  37.73 
 
 		 543 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.67 
 
 		 637 aa  337  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  35.95 
 
 		 635 aa  336  7e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  37.83 
 
 		 565 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  36.46 
 
 		 636 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  36.77 
 
 		 540 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.26 
 
 		 640 aa  335  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.26 
 
 		 640 aa  334  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.26 
 
 		 640 aa  334  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  31.77 
 
 		 645 aa  334  4e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  34.4 
 
 		 767 aa  333  5e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  37.52 
 
 		 540 aa  333  6e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  38.48 
 
 		 540 aa  333  9e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.26 
 
 		 637 aa  332  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  39.14 
 
 		 641 aa  332  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  36.26 
 
 		 633 aa  332  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0112  ABC transporter related  34.74 
 
 		 650 aa  331  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.339786  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  38.48 
 
 		 540 aa  331  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  34.69 
 
 		 646 aa  331  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  37.73 
 
 		 540 aa  330  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  38.1 
 
 		 540 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.08 
 
 		 639 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  36.42 
 
 		 540 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  37.82 
 
 		 544 aa  330  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.86 
 
 		 635 aa  330  7e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  35.09 
 
 		 535 aa  330  7e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  37.06 
 
 		 543 aa  330  7e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  36.3 
 
 		 634 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.86 
 
 		 635 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  36 
 
 		 646 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  37.41 
 
 		 540 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  36.4 
 
 		 540 aa  327  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  37.1 
 
 		 548 aa  326  9e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  33.98 
 
 		 667 aa  325  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 540 aa  325  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  33.98 
 
 		 619 aa  325  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  37.5 
 
 		 540 aa  325  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 		 632 aa  324  3e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  35.49 
 
 		 635 aa  324  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  36.84 
 
 		 540 aa  324  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  37.87 
 
 		 542 aa  323  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0996  ABC transporter related  37.66 
 
 		 536 aa  323  5e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.99181  normal  0.725541 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 		 545 aa  323  6e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  32.58 
 
 		 651 aa  323  6e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  36.13 
 
 		 624 aa  323  7e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  36.31 
 
 		 549 aa  323  7e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  36.91 
 
 		 548 aa  323  8e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  35.12 
 
 		 532 aa  323  8e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  31.39 
 
 		 644 aa  323  9.000000000000001e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  36.28 
 
 		 540 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  35.33 
 
 		 615 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  35.97 
 
 		 642 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 		 659 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  35.33 
 
 		 615 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  37.15 
 
 		 540 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  36.72 
 
 		 548 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  35.62 
 
 		 650 aa  320  7e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  35.59 
 
 		 540 aa  320  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3178  ABC transporter related  34.58 
 
 		 650 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  34.94 
 
 		 532 aa  319  9e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  36.11 
 
 		 615 aa  319  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.59 
 
 		 637 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  34.87 
 
 		 637 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  36.28 
 
 		 540 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  35.56 
 
 		 636 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  36.09 
 
 		 540 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  34.71 
 
 		 636 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  33.59 
 
 		 658 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  33.13 
 
 		 644 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  33.59 
 
 		 658 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  33.71 
 
 		 627 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  33.59 
 
 		 658 aa  317  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  34.92 
 
 		 643 aa  317  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  31.87 
 
 		 642 aa  317  4e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  33.59 
 
 		 640 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  31.87 
 
 		 642 aa  317  4e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  35.55 
 
 		 643 aa  317  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>