More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2772 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  100 
 
 
519 aa  1053    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.09 
 
 
531 aa  252  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.76 
 
 
536 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  31.58 
 
 
523 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  29.83 
 
 
526 aa  229  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  31.62 
 
 
525 aa  219  8.999999999999998e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  31.41 
 
 
527 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  31.57 
 
 
539 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  30.64 
 
 
557 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  31.43 
 
 
553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  29.56 
 
 
545 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  31.31 
 
 
532 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  30.22 
 
 
535 aa  210  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  30.95 
 
 
530 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  28.9 
 
 
536 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  32.02 
 
 
525 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  30.75 
 
 
538 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  30.95 
 
 
535 aa  204  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  30.92 
 
 
530 aa  203  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  29.73 
 
 
528 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  28.57 
 
 
554 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  28.54 
 
 
531 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  30.85 
 
 
537 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  30.85 
 
 
537 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  30.85 
 
 
537 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  30.04 
 
 
558 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  30.23 
 
 
541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  29.36 
 
 
533 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.11 
 
 
548 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  29.6 
 
 
529 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  29.03 
 
 
530 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  29.87 
 
 
529 aa  196  9e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  32.04 
 
 
525 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  31.37 
 
 
534 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  28.96 
 
 
541 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  30.46 
 
 
535 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  30 
 
 
529 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  28.88 
 
 
541 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  30.52 
 
 
546 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  28.93 
 
 
531 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  28.44 
 
 
549 aa  190  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  29.58 
 
 
548 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  29.14 
 
 
544 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  28.32 
 
 
535 aa  187  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  30.71 
 
 
546 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  29.22 
 
 
551 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  29.22 
 
 
551 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  29.13 
 
 
527 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  30.78 
 
 
548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.78 
 
 
548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.78 
 
 
548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  30.78 
 
 
548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.78 
 
 
548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  30.78 
 
 
548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.78 
 
 
548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06389  hypothetical protein  28.67 
 
 
436 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  28.39 
 
 
529 aa  183  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  29.47 
 
 
550 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  28.87 
 
 
524 aa  181  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  27.59 
 
 
534 aa  180  7e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  28.27 
 
 
532 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  27.99 
 
 
524 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  28.4 
 
 
553 aa  179  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  29.07 
 
 
577 aa  176  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  29.84 
 
 
531 aa  174  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  29.13 
 
 
555 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  28.22 
 
 
648 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  28.22 
 
 
534 aa  170  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  27.78 
 
 
548 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  31.53 
 
 
565 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  26.03 
 
 
520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  27.01 
 
 
545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  27.68 
 
 
580 aa  164  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  27.61 
 
 
532 aa  163  6e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  28.89 
 
 
664 aa  162  9e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  26.54 
 
 
641 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  29.34 
 
 
630 aa  161  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  25.94 
 
 
544 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  27.03 
 
 
516 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  28.46 
 
 
530 aa  160  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6763  ABC transporter related  29.85 
 
 
623 aa  160  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  31.98 
 
 
641 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  27.52 
 
 
546 aa  160  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  26.78 
 
 
541 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  26.54 
 
 
536 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  29.89 
 
 
545 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  27.84 
 
 
635 aa  158  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1915  ABC transporter ATPase  27.51 
 
 
518 aa  158  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  29.81 
 
 
537 aa  158  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  27.1 
 
 
627 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  27.85 
 
 
637 aa  157  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  26.91 
 
 
575 aa  157  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  28.21 
 
 
621 aa  156  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  27.74 
 
 
663 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5225  ABC transporter related  28.81 
 
 
517 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  26.59 
 
 
541 aa  156  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.35 
 
 
548 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.97 
 
 
644 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  28.42 
 
 
542 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  28.2 
 
 
663 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>